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Enregistrement W4327957106 · doi:10.1016/j.eclinm.2023.101909

Mortality by age, gene and gender in carriers of pathogenic mismatch repair gene variants receiving surveillance for early cancer diagnosis and treatment: a report from the prospective Lynch syndrome database

2023· article· en· W4327957106 sur OpenAlexaff
Mev Dominguez–Valentin, Saskia Haupt, Toni T. Seppälä, Julian R. Sampson, Lone Sunde, Inge Bernstein, Mark A. Jenkins, Christoph Engel, Stefan Aretz, Maartje Nielsen, Gabriel Capellá, Francesc Balaguer, D. Gareth Evans, John Burn, Elke Holinski‐Feder, Lucio Bertario, Bernardo Bonanni, Annika Lindblom, Zohar Levi, Finlay Macrae, Ingrid Winship, John‐Paul Plazzer, Rolf H. Sijmons, Luigi Laghi, Adriana Della Valle, Karl Heinimann, Tadeusz Dębniak, Robert Fruscio, Francisco Lopez-Koestner, Karin Alvarez-Valenzuela, Lior H. Katz, Ido Laish, E Vainer, Carlos Vaccaro, Dirce Maria Carraro, Kevin Monahan, Elizabeth Half, Áine Stakelum, D. C. Winter, Rory Kennelly, Nathan Gluck, Harsh Sheth, Naim Abu‐Freha, Marc S. Greenblatt, Bernard Rossi, Mábel Bohórquez, Giulia Martina Cavestro, Leonardo S. Lino‐Silva, Karoline Horisberger, Maria Grazia Tibiletti, Ivana do Nascimento, Huw Thomas, Norma Rossi, Leandro Apolinário da Silva, Attila Zaránd, Juan Ruiz‐Bañobre, Vincent Heuveline, Jukka‐Pekka Mecklin, Kirsi Pylvänäinen, Laura Renkonen‐Sinisalo, Anna Lepistö, Païvi Peltomäki, Christina Therkildsen, Mia Gebauer Madsen, Stefan Kobbelgaard Burgdorf, John L. Hopper, Aung Ko Win, Robert W. Haile, Noralane M. Lindor, Steven Gallinger, Loı̈c Le Marchand, Polly A. Newcomb, Jane C. Figueiredo, Daniel D. Buchanan, Stephen N. Thibodeau, Magnus von Knebel Doeberitz, Markus Loeffler, Nils Rahner, Evelin Schröck, Verena Steinke‐Lange, Wolff Schmiegel, Deepak Vangala, Claudia Perne, Robert Hüneburg, Silke Redler, Reinhard Büttner, Jürgen Weitz, Marta Pineda, Núria Dueñas, Leticia Moreira, Ariadna Sánchez, Eivind Hovig, Sigve Nakken, Kate Green, Fiona Lalloo, James Hill, Emma J. Crosbie, Miriam Mints, Yael Goldberg, Douglas Tjandra, Sanne W. ten Broeke, Revital Kariv, Guy Rosner, Suresh H. Advani, Lidiya Thomas, Pankaj Shah, Mithun Vinod Shah, Florencia Neffa, Patricia Esperón, Walter Pavicic, Giovana Tardin Torrezan, Thiago Bassaneze, Claudia Martin, Gabriela Möslein, Pål Møller

Notice bibliographique

RevueEClinicalMedicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteEuropean Regional Development FundRelander FoundationCentro de Investigación Biomédica en Red de CáncerInstituto de Salud Carlos IIISyöpäsäätiöMaag Lever Darm StichtingSigrid Juséliuksen SäätiöUniversità degli Studi di ParmaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloEmil Aaltosen SäätiöCancer Research UKKWF KankerbestrijdingCancer AustraliaAcademy of FinlandConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoKreftforeningenCentres de Recerca de CatalunyaJane ja Aatos Erkon SäätiöRoyal Melbourne HospitalMinisterio de Ciencia e InnovaciónGeneralitat de CatalunyaNational Institute for Health and Care ResearchNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchNational Institutes of HealthParc Geneteg CymruHealth and Care Research WalesDeutsche KrebshilfeMinisterio de Economía y CompetitividadVictorian Cancer Agency
Mots-clésMedicineLynch syndromeCancerGeneLifetime riskOncologyDatabaseDNA mismatch repairInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: ) who are receiving medical follow-up, including colonoscopy surveillance, which aims to the achieve early diagnosis and treatment of cancers. Here we use the most recent PLSD cohort that is larger and has wider geographical representation than previous versions, allowing us to present mortality as an outcome, and median ages at cancer diagnoses for the first time. Methods: variants from 25 countries were included, providing 71,713 years of follow up. Cumulative cancer incidences at 65 years of age were combined with 10-year crude survival following cancer, to derive estimates of mortality up to 75 years of age by organ, gene, and gender. Findings: carriers, more deaths followed non-colorectal Lynch syndrome cancers than colorectal cancers. Interpretation: carriers undergoing colonoscopy surveillance, non-colorectal Lynch syndrome cancers were associated with more deaths than were colorectal cancers. Reducing deaths from non-colorectal cancers presents a key challenge in contemporary medical care in Lynch syndrome. Funding: We acknowledge funding from the Norwegian Cancer Society, contract 194751-2017.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,853

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations110
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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