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Enregistrement W4328010626 · doi:10.5376/cmb.2023.13.0002

Identification and Bioinformatics Analysis of TCP Family Genes in Tree Peony

2023· article· en· W4328010626 sur OpenAlexvenueno aff
Yanzhao Zhang, Xin Luo, Huiyun Li, Xujia Duan, Yan Zhang, Fanjuan Meng

Notice bibliographique

RevueComputational Molecular Biology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématique14-3-3 protein interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneGene familyPhylogenetic treeGeneticsBotanyGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor) family gene is a kind of plant specific transcription factor, which plays a significant role in regulating plant growth and development. In this study, 18 TCP genes were identified from the tree peony transcriptome data, the molecular weight was between 18 978.32 and 51 789.56 Da, the isoelectric points was between 5.81 and 9.45, and the subcellular localization prediction of TCP family members was in the nucleus. The classification of conserved amino acids in the tree peony TCP domain was similar to that of Arabidopsis thaliana. Phylogenetic analysis showed that the TCP proteins of tree peony were divided into two categories, Class Ⅰ contained 10 TCP members, and Class Ⅱ contained 8 TCP members. MEME analysis results showed that 15 conserved domains were found in the tree peony TCP protein, Motif 1 was the TCP domain, and was found in all TCP members. Meanwhile, the transcription level of the tree peony TCP genes in bud, leaf, petal, piebaldness, stamen, pistil and seed were analyzed. This article systematically analyzed the tree peony TCP family genes, which provided a scientific basis for further research on functional genes and molecular breeding in tree peony.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,863
Score d'incertitude au seuil0,404

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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