Identification and Bioinformatics Analysis of TCP Family Genes in Tree Peony
Notice bibliographique
Résumé
The TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor) family gene is a kind of plant specific transcription factor, which plays a significant role in regulating plant growth and development. In this study, 18 TCP genes were identified from the tree peony transcriptome data, the molecular weight was between 18 978.32 and 51 789.56 Da, the isoelectric points was between 5.81 and 9.45, and the subcellular localization prediction of TCP family members was in the nucleus. The classification of conserved amino acids in the tree peony TCP domain was similar to that of Arabidopsis thaliana. Phylogenetic analysis showed that the TCP proteins of tree peony were divided into two categories, Class Ⅰ contained 10 TCP members, and Class Ⅱ contained 8 TCP members. MEME analysis results showed that 15 conserved domains were found in the tree peony TCP protein, Motif 1 was the TCP domain, and was found in all TCP members. Meanwhile, the transcription level of the tree peony TCP genes in bud, leaf, petal, piebaldness, stamen, pistil and seed were analyzed. This article systematically analyzed the tree peony TCP family genes, which provided a scientific basis for further research on functional genes and molecular breeding in tree peony.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».