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Enregistrement W4361186947 · doi:10.1016/j.hlife.2023.02.001

Emergence of hypervirulent Pseudomonas aeruginosa pathotypically armed with co-expressed T3SS effectors ExoS and ExoU

2023· article· en· W4361186947 sur OpenAlexfundno aff
Yuqin Song, YongQi Mu, Nai-Kei Wong, Zhuo Yue, Juan Li, Min Yuan, Xiong Zhu, Jinshu Hu, Gang Zhang, Dawei Wei, Chao Wang, Weihui Wu, Fang Bai, Jie Feng

Notice bibliographique

RevuehLife · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of China Stem Cell and Translational ResearchNational Key Research and Development Program of ChinaInternational Development Research Centre
Mots-clésVirulencePseudomonas aeruginosaType three secretion systemMicrobiologyPathogenicity islandEffectorBiologySecretionPathogenGeneBacteriaGeneticsImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas aeruginosa is a significant pathogen mainly causing healthcare-associated infections (HAIs). Newly emerging high-risk clones of P. aeruginosa with elevated virulence profiles furtherly cause severe community-acquired infections (CAIs). Usually, it is not common for P. aeruginosa to co-carry exoU and exoS genes, encoding two type III secretion system (T3SS) effectors. The pathogenicity mechanism of exoS+/exoU+ strains of P. aeruginosa remains unclear. Here, we provide detailed evidence for a subset of hypervirulent P. aeruginosa strains, which abundantly co-express and secrete the T3SS effectors ExoS and ExoU. The exoS+/exoU+ P. aeruginosa strains were available to cause both HAIs and CAIs. The CAI-associated strains could elicit severe inflammation and hemorrhage, leading to higher death rates in a murine acute pneumonia model, and had great virulence potential in establishing chronic infections, demonstrating hypervirulence when compared to PAO1 (exoS+/exoU-) and PA14 (exoS-/exoU+). Both ExoS and ExoU were co-expressed and co-secreted in abundance in exoS+/exoU+ strains. Their abundant protein secretion could boost exoS+/exoU+ strains’ potentials for cytotoxicity in vitro and pathogenicity in vivo. Genomic evidence indicates that exoU acquisition is likely mediated by horizontal gene transfer (HGT) of the pathogenicity island PAPI-2, while deletion of exoU was sufficient to mitigate virulence in the exoS+/exoU+ strains. Furthermore, bioinformatics analysis showed that such exoS+/exoU+ P. aeruginosa strains turned out to be widely distributed across the globe. Overall, the research provide detailed evidence for the high virulence and epidemicity of exoS+/exoU+ strains of P. aeruginosa, highlighting an urgent need for surveillance against these high-risk hypervirulent strains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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