Abstract 3938: <i>In vivo</i> genome-wide CRISPR screen in pancreatic ductal adenocarcinoma defines HSPE1 as a potential oncogene by acting through G2/M cell cycle arrest
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Superior knowledge of cancer biology has enabled unprecedented innovations in therapies targeting mutated driver genes. Despite the attempt of targeting cancer-inducing genes such as KRAS, the life expectancy of patients diagnosed with pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) has poorly improved. We performed an unbiased genome wide in-vivo loss-of-function CRISPR screen to discover novel oncogenes and identified heat-shock protein HSPE1, whose function is still unknown in PDAC. By decreasing HSPE1 expression with shRNA and CRISPR technology, we detected a slowdown in cell growth of PDAC cancer cells. HSPE1 knock-out cells injected in mice displayed a drastic reduction in tumor volume. We exploited this vulnerability by disrupting HSPE1 function by using KHS101, a validated HSPD1-HSPE1 complex inhibitor. Several PDAC cell lines cultured in vitro were sensitive upon KHS101 treatment and in vivo administration of KHS101 reduced tumorigenesis. Compiling the negative fitness scores from DepMap database revealed a co-dependency between HSPE1 and PLK1, a protein involved in regulating G2/M checkpoint. Indeed, we detected a protein-level decrease of PLK1 in our experimental model of PDAC cells having either a drug-induced HSPE1 deficiency by KHS101 exposure or a HSPE1 gene-expression reduction by shRNA. We found that the cell cycle was disrupted through G2/M arrest in PDAC cells treated with KHS101. Our findings highlight a new role underlying PDAC tumorigenesis for HSPE1 and could unlock a new area of research towards precision medicine. Citation Format: Julien Boudreault, Ni Wang, Gang Yan, Meiou Dai, Sophie Poulet, Girija Daliah, Jean-Jacques Lebrun. In vivo genome-wide CRISPR screen in pancreatic ductal adenocarcinoma defines HSPE1 as a potential oncogene by acting through G2/M cell cycle arrest. [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2023; Part 1 (Regular and Invited Abstracts); 2023 Apr 14-19; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2023;83(7_Suppl):Abstract nr 3938.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».