MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4362676476 · doi:10.1371/journal.pgen.1010709

Recognition of commensal bacterial peptidoglycans defines Drosophila gut homeostasis and lifespan

2023· article· en· W4362676476 sur OpenAlexfundno aff
Taro Onuma, T. Yamauchi, Hina Kosakamoto, Hibiki Kadoguchi, Takayuki Kuraishi, Takumi Murakami, Hiroshi Mori, Masayuki Miura, Fumiaki Obata

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFusion Oriented REsearch for disruptive Science and TechnologyJapan Science and Technology AgencyJapan Society for the Promotion of ScienceYakult Bio-Science FoundationInstitute of GeneticsJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésBiologyPeptidoglycanDrosophila melanogasterAntimicrobial peptidesMicrobiologyMidgutTranscriptomeCell biologyGut floraAgeingLongevityDefensinBacteriaGeneticsImmunologyAntimicrobialGeneGene expressionEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Commensal microbes in animals have a profound impact on tissue homeostasis, stress resistance, and ageing. We previously showed in Drosophila melanogaster that Acetobacter persici is a member of the gut microbiota that promotes ageing and shortens fly lifespan. However, the molecular mechanism by which this specific bacterial species changes lifespan and physiology remains unclear. The difficulty in studying longevity using gnotobiotic flies is the high risk of contamination during ageing. To overcome this technical challenge, we used a bacteria-conditioned diet enriched with bacterial products and cell wall components. Here, we demonstrate that an A. persici-conditioned diet shortens lifespan and increases intestinal stem cell (ISC) proliferation. Feeding adult flies a diet conditioned with A. persici, but not with Lactiplantibacillus plantarum, can decrease lifespan but increase resistance to paraquat or oral infection of Pseudomonas entomophila, indicating that the bacterium alters the trade-off between lifespan and host defence. A transcriptomic analysis using fly intestine revealed that A. persici preferably induces antimicrobial peptides (AMPs), while L. plantarum upregulates amidase peptidoglycan recognition proteins (PGRPs). The specific induction of these Imd target genes by peptidoglycans from two bacterial species is due to the stimulation of the receptor PGRP-LC in the anterior midgut for AMPs or PGRP-LE from the posterior midgut for amidase PGRPs. Heat-killed A. persici also shortens lifespan and increases ISC proliferation via PGRP-LC, but it is not sufficient to alter the stress resistance. Our study emphasizes the significance of peptidoglycan specificity in determining the gut bacterial impact on healthspan. It also unveils the postbiotic effect of specific gut bacterial species, which turns flies into a "live fast, die young" lifestyle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,766

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS GeneticsMême sujetInvertebrate Immune Response MechanismsTravaux en français237 207