MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4363647866 · doi:10.3390/biology12040572

Characterization of Adenylyl Cyclase Isoform 6 Residues Interacting with Forskolin

2023· article· en· W4363647866 sur OpenAlexafffund
Vikram Bhatia, Saeid Maghsoudi, Martha Hinton, Anjali Y. Bhagirath, Nisha Singh, Appalaraju Jaggupilli, Prashen Chelikani, Shyamala Dakshinamurti

Notice bibliographique

RevueBiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNitric Oxide and Endothelin Effects
Établissements canadiensUniversity of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of ManitobaResearch Manitoba
Organismes subventionnairesPurdue UniversityHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésBiologyAdenylyl cyclaseForskolinADCY9Gene isoformADCY10BiochemistryCell biologyEnzymeGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The adenylyl cyclase (AC) pathway, crucial for pulmonary vasodilation, is inhibited by hypoxia. Forskolin (FSK) binds allosterically to AC, stimulating ATP catalysis. As AC6 is the primary AC isoform in the pulmonary artery, selective reactivation of AC6 could provide targeted reinstatement of hypoxic AC activity. This requires elucidation of the FSK binding site in AC6. METHODS: ) or exposed to s-nitrosocysteine (CSNO). AC activity was measured using terbium norfloxacin assay; AC6 structure built by homology modeling; ligand docking to examine FSK-interacting amino acids; roles of selected residues determined by site-directed mutagenesis; FSK-dependent cAMP generation measured in wild-type and FSK-site mutants by biosensor-based live cell assay. RESULTS: Only AC6 is inhibited by hypoxia and nitrosylation. Homology modeling and docking revealed residues T500, N503, and S1035 interacting with FSK. Mutation of T500, N503, or S1035 decreased FSK-stimulated AC activity. FSK site mutants were not further inhibited by hypoxia or CSNO; however, mutation of any of these residues prevented AC6 activation by FSK following hypoxia or CSNO treatment. CONCLUSIONS: FSK-interacting amino acids are not involved in the hypoxic inhibition mechanism. This study provides direction to design FSK derivatives for selective activation of hypoxic AC6.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,408
Score d'incertitude au seuil0,175

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiologyMême sujetNitric Oxide and Endothelin EffectsTravaux en français237 207