Phylogenetic assessment of Apophallines (Digenea: Opisthorchiidae) with revision of <i>Apophallus donicus</i> Skrjabin & Lindtrop, 1919 complex and some taxonomic propositions
Notice bibliographique
Résumé
According to the current taxonomic concept, the Аpophallinae Ciurea, Citation1924 is a monotypic subfamily of the Opisthorchiidae that comprises species with a median permanent ventrogenital sac containing a well-developed ventral sucker and two gonotyls. A recently formulated molecular hypothesis suggests polyphyly of this subfamily and the presence of two sibling species within one of the nominal species A. donicus Skrjabin & Lindrop, Citation1919. In this paper, we redescribed A. donicus s. str. and renamed A. donicus auct. non Skrjabin & Lindrop, Citation1919 to A. lari (Leonov, Citation1957) based on morphological, biological and molecular (mitochondrial cox1 gene fragments) data. The main morphological differences between species are the length of the distance between the anterior end of the body and the anterior extremity of the vitellarium as a ratio to the forebody length, and the shape of the anterior vitelline follicles. We also aimed to test the monophyly of the Аpophallinae through nuclear-ribosomal molecular markers 18S + 28S rDNA. Tree topology showed Apophallus zalophi (Price, Citation1932) clustered closer to Liliatrema Gubanov, 1953 than to the other Apophallus spp. As a result, we resurrect the genus Pricetrema Ciurea, Citation1933 that earlier was proposed for A. zalophi and abolish the Liliatrematinae Gubanov, 1953 with removal of Liliatrema into the Apophallinae. Thus, according to the updated concept, the Apophallinae contains three genera, Apophallus Lühe, 1909, Liliatrema and Pricetrema, two of which (Apophallus, Pricetrema) have the ventrogenital sac with two gonotyls and one (Liliatrema) has a genital sac without gonotyls.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».