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Enregistrement W4365420443 · doi:10.5376/ija.2023.13.0001

Cloning and Characterization of Aquaporins 11 and Its Expression Analysis under Molt Cycle in <i>Eriocheir sinensis</i>

2023· article· en· W4365420443 sur OpenAlexvenueno aff
Long Zhang, Yangyang Pang, Hang Yang, Zhigang Yang

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Aquaculture · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChinese mitten crabComplementary DNABiologyOpen reading frameMolecular biologyAquaporinRapid amplification of cDNA endsHepatopancreasGene expressionMolecular cloningEriocheirGenePeptide sequenceGeneticsBiochemistryFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aquaporins play important roles in water molecule transport, ion transport, and osmotic pressure regulation. In this study, the full-length cDNA of aquaporin from Chinese mitten crab ( Eirocheir sinensis ) was cloned for first time using reverse transcription-polymerase chain reaction and rapid amplification of cDNA ends analyses. The full-length of AQP11 cDNA is 1746bp, with a 463bp 5’-untranslated region (UTR), a 476bp 3’-UTR, and an open reading frame (ORF) of 807 bp which encodes a 269 amino acid polypeptide. The molecular mass of the predicted protein is 29.46 kDa with an estimated PI of 5.38. Bioinformatics software analysis revealed that AQP11 gene contains 4 transmembrane domains, 2 NPV structural units. Homologous analysis showed that AQP11 of Eirocheir sinensis  has the highest homology to AQP11 of Litopenaeus vanname i .  Real-time quantitative RT-PCR showed that AQP11 gene could be detected in all tested tissues of Eirocheir sinensis , with the highest expression level in intestine, followed by the brain, muscle and thoracic ganglion, and the lowest expression level in the hepatopancreas, gills and blood. In the intestinal, the expression of AQP11 was significantly lower at the intermolt stage (stages C) and premolt stage (stage D), significantly enhanced and reached the maximal level at the ecdysis stage (stage E). On the other hand, the expression of AQP11 gene in muscle showed low expression in the intermolt stage (stage C), and it was increased gradually at the premolt stage (stage D), significantly enhanced and reached the maximal level at the ecdysis stage (E stage), and then reaching the postmolt stage(AB stage) decline. In summary, our results indicate that AQP11 may play an important role in molting of Enirocheir sinensis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,451
Score d'incertitude au seuil0,332

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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