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Enregistrement W4366205472 · doi:10.1002/cpz1.744

Evaluation of Neurotoxicity With Human Pluripotent Stem Cell–Derived Cerebral Organoids

2023· article· en· W4366205472 sur OpenAlexafffund
Thomas Parmentier, Jonathan LaMarre, Jasmin Lalonde

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaScottish Rite Charitable Foundation of CanadaFondation Brain Canada
Mots-clésOrganoidNeurogenesisInduced pluripotent stem cellNeuroscienceHuman brainCell typeBiologyCellEmbryonic stem cellBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The recent development of human cerebral organoids provides an invaluable in vitro model of human brain development to assess the toxicity of natural or man-made toxic substances. By recapitulating key aspects of early human neurodevelopment, investigators can evaluate with this three-dimensional (3D) model the effect of certain compounds on the formation of neuronal networks and their electrophysiological properties with more physiological relevance than neurons grown in monolayers and in cultures composed of a unique cell type. This promising potential has contributed to the development of a large number of diverse protocols to generate human cerebral organoids, making interlaboratory comparisons of results difficult. Based on a previously published protocol to generate human cortical organoids (herein called cerebral organoids), we detail several approaches to evaluate the effect of chemicals on neurogenesis, apoptosis, and neuronal function when exogenously applied to cultured specimens. Here, we take as an example 4-aminopyridine, a potassium channel blocker that modulates the activity of neurons and neurogenesis, and describe a simple and cost-effective way to test the impact of this agent on cerebral organoids derived from human induced pluripotent stem cells. We also provide tested protocols to evaluate neurogenesis in cerebral organoids with ethynyl deoxyuridine labeling and neuronal activity with live calcium imaging and microelectrode arrays. Together, these protocols should facilitate the implementation of cerebral organoid technologies in laboratories wishing to evaluate the effects of specific compounds or conditions on the development and function of human neurons with only basic cell culture equipment. © 2023 The Authors. Current Protocols published by Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1: Generation of human cerebral organoids from pluripotent stem cells Support Protocol 1: Human pluripotent stem cell culture Basic Protocol 2: Evaluation of neurogenesis in cerebral organoids with ethynyl deoxyuridine labeling Basic Protocol 3: Calcium imaging in cerebral organoids Basic Protocol 4: Electrophysiological evaluation of cerebral organoids with microelectrode arrays Support Protocol 2: Immunostaining of cerebral organoids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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