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Enregistrement W4366772115 · doi:10.3390/ddc2020015

Design, Synthesis and In Vitro Studies of 3-Amidocoumarins as Novel Antibiofilm Agents

2023· article· en· W4366772115 sur OpenAlexfundno aff
Rajesh Kumar Sharma, Vineeta Singh, Vaishali Raghuvanshi, Diksha Katiyar

Notice bibliographique

RevueDrugs and Drug Candidates · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBanaras Hindu UniversityCouncil for Scientific and Industrial Research, South AfricaScience and Engineering Research BoardCanadian Institute of Steel Construction
Mots-clésBiofilmPseudomonas aeruginosaQuorum sensingDocking (animal)ChemistryMicrobiologyAntibioticsIn vitroContext (archaeology)Antibiotic resistanceBacteriaBiologyBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas aeruginosa, a life-threatening bacteria listed as a priority pathogen by World Health Organization WHO, is known to cause severe nosocomial infections and fatality in immunocompromised individuals through its quorum sensing (QS) mediated biofilm formation. P. aeruginosa’s antibiotic-resistant biofilms are highly challenging to the existing antibiotic treatment options. There is an urgent clinical need to develop novel alternative therapeutic molecules such as antibiofilm and antiquorum sensing agents to counter the emergence of an unprecedented pace of antibiotic resistance of pathogens. In this context, a library of seventy 3-amidocoumarin derivatives was designed, and docking studies were performed against the P. aeruginosa LasR receptor using AutoDock 4.0. Based on docking results, a final series of sixteen 3-amidocoumarin derivatives (4a–p) were synthesized and evaluated for antibiofilm activity in vitro. Eight compounds significantly inhibited the formation of P. aeruginosa PAO1 biofilm. Compounds 4f, 4l and 4o showed maximum % inhibition in antibiotic-resistant P. aeruginosa PAO1 biofilm formation in the range of 80% to 86%. Further, the structure–activity relationship (SAR) studies revealed that the presence of electron-donating and bromo substituents at benzamido and coumarin moieties, respectively, effectively enhances the antibiofilm activity. In addition, the binding interactions between the synthesized compounds and active sites of the LasR QS receptor (Protein Data Bank Code: 2uv0) in P. aeruginosa were also investigated by molecular docking. The high binding affinities indicate that these compounds might be suitable for development into potent inhibitors of QS and biofilm disruptors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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