<sub> Altered neutrophil extracellular traps in response to <i>Mycobacterium tuberculosis</i> in persons living with HIV with no previous TB and negative TST and IGRA </sub>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Persons living with HIV (PLWH) have an increased risk for tuberculosis (TB). After prolonged and repeated exposure, some PLWH never develop TB and test persistently negative in tests of immune sensitization tuberculin skin test (TST) and interferon gamma release assays (IGRA) for Mycobacterium tuberculosis ( Mtb) . This group has been identified and defined as HIV+ persistently TB, tuberculin and IGRA negative (HITTIN). To investigate potential innate mechanisms unique to individuals with the HITTIN phenotype we compared their neutrophil Mtb infection response to that of PLWH, with no TB history, but who test persistently IGRA positive, and tuberculin positive (HIT). Neutrophil samples from 17 HITTIN (PMN HITTIN ) and 11 HIT (PMN HIT ) were isolated and infected with Mtb H37Rv for 1h and 6h. RNA was extracted and used for RNAseq analysis. At 1h of Mtb infection, PMN HITTIN displayed 151 significantly upregulated and 40 significantly downregulated differentially expressed genes (DEGs) and PMN HIT 98 significantly upregulated and 11 significantly downregulated DEGs. At the 6h timepoint, PMN HITTIN displayed 3106 significantly upregulated and 3548 significantly downregulated DEGs while PMN HIT had 3816 significantly up- and 3794 significantly downregulated DEGs. There was no significant differential transcriptional response at 1h between infected PMN HITTIN and PMN HIT. However, when contrasting the log 2 FC 6h infection response to Mtb from PMN HITTIN against PMN HIT , 2285 genes showed significant differential response between the two groups. Apoptosis and NETosis were key pathways linked to the enrichment of genes in PMN HITTIN when contrasted to PMN HIT after 6h infection with Mtb . Fluorescence microscopy revealed relatively lower neutrophil extracellular trap formation and cell loss in PMN HITTIN compared to PMN HIT , showing that PMN HITTIN have a distinct response to Mtb .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».