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Enregistrement W4366813944 · doi:10.1016/j.xplc.2023.100609

BnaOmics: A comprehensive platform combining pan-genome and multi-omics data from Brassica napus

2023· article· en· W4366813944 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePlant Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgricultural Science and Technology Innovation ProgramNational Key Research and Development Program of ChinaChinese Academy of Agricultural SciencesAgriculture and Agri-Food CanadaChina Agricultural Research SystemNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBrassicaOmicsComputational biologyGenomeBiologyComputer scienceData scienceBioinformaticsGeneticsGeneBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A comprehensive platform combining pan-genome and multi-omics data from Brassica napus Dear Editor, Brassica napus was originally formed $7500 years ago by the interspecific hybridization of B. rapa and B. oleracea (Chalhoub et al., 2014).It accounts for approximately 13%-16% of global vegetable oil production and provides an excellent model for polyploid genomics and evolutionary research in plants.Currently, the Brassicaceae Database (BRAD V3.0; Chen et al., 2022), Genoscope (https://www.genoscope.cns.fr/brassicanapus/), and Ensembl Plants (https://plants.ensembl.org)are used for genomic research pertaining to B. napus.However, they only provide genome browsers for research into the B. napus cultivar Darmorbzh.The B. napus pan-genome information resource (BnPIR) also provides eight B. napus reference genomes (Song et al., 2021), gene information, and resequencing data.The B. napus variation information resource (BnVIR) provides information on genetic variation, including single-nucleotide polymorphisms (SNPs), insertions or deletions (INDELs), and structural variations (SVs) (Yang et al., 2022).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,977
Score d'incertitude au seuil0,598

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,143
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle