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Enregistrement W4367172901 · doi:10.1002/fft2.234

Genome‐wide analysis, metabolomics, and transcriptomics reveal the molecular basis of <i>ZlRc</i> overexpression in promoting phenolic compound accumulation in rice seeds

2023· article· en· W4367172901 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFood Frontiers · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgricultural Science and Technology Innovation ProgramChinese Academy of Agricultural Sciences
Mots-clésChalcone synthaseChalcone isomeraseFlavonoid biosynthesisFlavonoidBiochemistryLuteolinBiologyFlavanoneTranscriptomePhenylpropanoidBiosynthesisEnzymeGeneBotanyChemistryAntioxidantGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Chinese wild rice ( Zizania latifolia ) is rich in phenolic compounds, particularly flavonoids. This study identified 203 basic helix‐loop‐helix (bHLHs) in Z. latifolia and showed that ZlbHLH196 ( Zla16G011250 ) corresponds to the ZlRc gene in Z. latifolia , with its protein product localizing to the nucleus. Notably, the pericarps of ZlRc ‐overexpressing (OE) rice are brown, whereas those of wild‐type (WT) rice are nonpigmented. The total phenolic, flavonoid, and proanthocyanidin contents, antioxidant activity, as well as enzyme inhibitory effects of ZlRc ‐OE rice were significantly higher than those of WT rice. Overall, 221 differential phenolic metabolites were identified between ZlRc ‐OE and WT rice, among which 198 were upregulated in the former. Additionally, a total of 227 differentially expressed genes were identified between ZlRc ‐OE and WT rice, with 173 upregulated. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes annotation and enrichment analysis of phenolic metabolites revealed enhanced isoflavonoid, flavone, flavonol, and flavonoid biosynthesis pathways in ZlRc ‐OE rice, which, furthermore, showed a markedly upregulated expression and significantly higher activities of four key flavonoid biosynthesis–related enzymes (phenylalanine ammonia‐lyase, chalcone synthase, chalcone‐flavanone isomerase, and dihydroflavonol 4‐reductase). These findings show that ZlRc ‐overexpression promotes phenolic compound accumulation in rice seeds and can be used to bioaugment rice phenolic content.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,169
Score d'incertitude au seuil0,598

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle