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Enregistrement W4367676995 · doi:10.7554/elife.87135.1.sa2

eLife Assessment: Tetraose steroidal glycoalkaloids from potato can provide complete protection against fungi and insects

2023· peer-review· en· W4367676995 sur OpenAlexaff
Jacqueline Monaghan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePotato Plant Research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBiotechnologySolanumPlant disease resistanceResistance (ecology)Host (biology)Plant defense against herbivoryGenetically modified cropsGeneBotanyTransgeneGeneticsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plants with innate disease and pest resistance can contribute to more sustainable agriculture. Plant breeders typically focus on immune receptors or impaired susceptibility genes to develop resistant crops, but these can present challenges in terms of strength, durability or pleotropic effects. Although natural defence compounds produced by plants have the potential to provide a general protective effect against pathogens and pests, they are not a primary target in resistance breeding. The precise contribution of defence metabolites to plant immunity is often unclear and the genetics underlying their biosynthesis is complex. Here, we identified a wild relative of potato, Solanum commersonii, that provides us with unique insight in the role of glycoalkaloids in plant immunity. We cloned two atypical resistance genes that can provide complete resistance to Alternaria solani and Colorado potato beetle through the production of tetraose steroidal glycoalkaloids. Moreover, we show that these compounds are active against a wide variety of fungi. This research provides a direct link between specific modifications to steroidal glycoalkaloids of potato and resistance against diseases and pests. Further research on the biosynthesis of plant defence compounds in different tissues, their toxicity, and the mechanisms for detoxification, can aid the effective use of such compounds to improve sustainability of our food production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,194

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0580,018

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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