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Enregistrement W4372294498 · doi:10.1038/s41467-023-37194-5

Clarifying the effect of biodiversity on productivity in natural ecosystems with longitudinal data and methods for causal inference

2023· article· en· W4372294498 sur OpenAlexaff
Laura E. Dee, Paul J. Ferraro, Christopher N. Severen, Kaitlin Kimmel, Elizabeth T. Borer, Jarrett E. K. Byrnes, Adam Thomas Clark, Yann Hautier, Andy Hector, Xavier Raynaud, Peter B. Reich, Alexandra J. Wright, Carlos Alberto Arnillas, Kendi F. Davies, Andrew MacDougall, Akira Mori, Melinda D. Smith, Peter B. Adler, Jonathan D. Bakker, Kate A. Brauman, Jane Cowles, Kimberly J. Komatsu, Johannes M. H. Knops, Rebecca L. McCulley, Joslin L. Moore, John W. Morgan, Timothy Ohlert, Sally A. Power, Lauren L. Sullivan, Carly Stevens, Michel Loreau

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcology and Vegetation Dynamics Studies
Établissements canadiensUniversity of GuelphThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Aeronautics and Space AdministrationAgence Nationale de la RechercheNational Science Foundation
Mots-clésObservational studySpecies richnessBiodiversityCausal inferenceProductivityConfoundingEcologyEcosystemInferenceNatural experimentBiologyEconometricsComputer scienceEconomicsStatisticsMathematicsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Causal effects of biodiversity on ecosystem functions can be estimated using experimental or observational designs - designs that pose a tradeoff between drawing credible causal inferences from correlations and drawing generalizable inferences. Here, we develop a design that reduces this tradeoff and revisits the question of how plant species diversity affects productivity. Our design leverages longitudinal data from 43 grasslands in 11 countries and approaches borrowed from fields outside of ecology to draw causal inferences from observational data. Contrary to many prior studies, we estimate that increases in plot-level species richness caused productivity to decline: a 10% increase in richness decreased productivity by 2.4%, 95% CI [-4.1, -0.74]. This contradiction stems from two sources. First, prior observational studies incompletely control for confounding factors. Second, most experiments plant fewer rare and non-native species than exist in nature. Although increases in native, dominant species increased productivity, increases in rare and non-native species decreased productivity, making the average effect negative in our study. By reducing the tradeoff between experimental and observational designs, our study demonstrates how observational studies can complement prior ecological experiments and inform future ones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,219
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,414
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil0,963

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2190,414
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,004
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0020,006
Communication savante0,0040,006
Science ouverte0,0030,006
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations126
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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