MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4372331783 · doi:10.1038/s41467-023-38301-2

Hybrids of RNA viruses and viroid-like elements replicate in fungi

2023· article· en· W4372331783 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Interactions Research
Établissements canadiensOntario Tobacco Research UnitUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity of British ColumbiaMinisterio de Economía y CompetitividadCanadian Institutes of Health ResearchEuropean Commission
Mots-clésViroidRNARibozymeBiologyCircular RNAGenomeGeneticsVirologyPlant virusLigase ribozymeRNA silencingComputational biologyGeneVirusRNA interference

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Earth's life may have originated as self-replicating RNA, and it has been argued that RNA viruses and viroid-like elements are remnants of such pre-cellular RNA world. RNA viruses are defined by linear RNA genomes encoding an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), whereas viroid-like elements consist of small, single-stranded, circular RNA genomes that, in some cases, encode paired self-cleaving ribozymes. Here we show that the number of candidate viroid-like elements occurring in geographically and ecologically diverse niches is much higher than previously thought. We report that, amongst these circular genomes, fungal ambiviruses are viroid-like elements that undergo rolling circle replication and encode their own viral RdRp. Thus, ambiviruses are distinct infectious RNAs showing hybrid features of viroid-like RNAs and viruses. We also detected similar circular RNAs, containing active ribozymes and encoding RdRps, related to mitochondrial-like fungal viruses, highlighting fungi as an evolutionary hub for RNA viruses and viroid-like elements. Our findings point to a deep co-evolutionary history between RNA viruses and subviral elements and offer new perspectives in the origin and evolution of primordial infectious agents, and RNA life.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,645
Score d'incertitude au seuil0,215

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle