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Enregistrement W4375852844 · doi:10.21203/rs.3.rs-2885147/v1

The splicing factor SRSF6 regulates AR activity and represents a potential therapeutic target in prostate cancer

2023· preprint· en· W4375852844 sur OpenAlexaff
Juan M. Jiménez‐Vacas, Antonio J. Montero‐Hidalgo, Enrique Gómez‐Gómez, Prudencio Sáez-Martínez, Jesús M. Pérez‐Gómez, Antonio C. Fuentes-Fayos, Ricardo Blázquez‐Encinas, Rafael Sánchez‐Sánchez, Teresa Gonzalez-Serrano, Elena Castro, Pablo Jesús López‐Soto, Julia Carrasco‐Valiente, André Sarmento-Cabral, Antonio J. Martínez‐Fuentes, Eduardo Eyras, Justo P. Castaño, Adam Sharp, David Olmos, Manuel D. Gahete, Raúl M. Luque

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesEuropean Social FundEuropean Regional Development FundInstituto de Salud Carlos IIIMinisterio de Sanidad, Servicios Sociales e IgualdadEuropean Commission
Mots-clésGene silencingProstate cancerCancer researchRNA splicingBiologyMetastasisCancerTranscription factorAlternative splicingMessenger RNAGeneRNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Prostate cancer (PCa) is the fifth leading cause of cancer-related death worldwide. Finding novel therapeutic strategies to tackle PCa, especially its most advanced phenotype, named castration-resistant PCa (CRPC), is urgently needed. In this sense, although the dysregulation of the splicing process has emerged as a distinctive feature of advanced PCa, the potential role that splicing regulators may play in advanced PCa remains understudied. In this project, we aimed to explore the levels, pathophysiological role, and associated molecular landscape of the splicing factor SRSF6 in PCa.Methods SRSF6 alterations (CNA/mRNA/protein) were analyzed in eight well-characterized cohorts of PCa patients and in the Hi-MYC transgenic model. The effect of SRSF6 overexpression and silencing was tested in vitro (cell proliferation, migration, colony and tumorspheres formation), and in vivo (xenograft tumors). RNA-Seq was performed in PCa cells to analyze gene expression and splicing pattern changes in response to SRSF6 silencing.Results Our results showed that SRSF6 levels (mRNA/protein) were upregulated in PCa vs. non-tumor prostate samples, linked to clinical parameters of tumor aggressiveness (e.g., Gleason score, T-stage, perineural infiltration, metastasis at diagnosis), and associated with poor prognosis (i.e., shorter progression-free survival time) in PCa patients. Moreover, SRSF6 overexpression increased, while its silencing decreased, relevant functional parameters of aggressiveness in vitro and tumor growth in vivo. Mechanistically, SRSF6 modulation resulted in the dysregulation of key oncogenic pathways, especially AR-activity through transcriptional regulation of APPBP2 and TOP2BConclusions SRSF6 could represent a new therapeutic target to inhibit persistent AR-signaling in advanced PCa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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