Surface exclusion of IncC conjugative plasmids and their relatives
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The phenomenon of exclusion allows conjugative plasmids to selectively impede the entry of identical or related elements into their host cell to prevent the resulting instability. Entry exclusion blocks DNA translocation into the recipient cell, whereas surface exclusion destabilizes the mating pair. IncC conjugative plasmids largely contribute to the dissemination of antibiotic-resistance genes in Gammaproteobacteria. IncC plasmids are known to exert exclusion against their relatives, including IncC and IncA plasmids, yet the entry exclusion factor eexC alone does not account for the totality of the exclusion phenotype. In this study, a transposon-directed insertion sequencing approach identified sfx as necessary and sufficient for the remaining exclusion phenotype. Sfx is an exclusion factor unrelated to the ones described to date. A cell fractionation assay localized Sfx in the outer membrane. Reverse transcription PCR and beta-galactosidase experiments showed that sfx is expressed constitutively at a higher level than eexC . A search in Gammaproteobacteria genomes identified Sfx homologs encoded by IncC, IncA and related, untyped conjugative plasmids and an uncharacterized family of integrative and mobilizable elements that likely rely on IncC plasmids for their mobility. Mating assays demonstrated that sfx is not required in the donor for exclusion, ruling out Sfx as the exclusion target. Instead, complementation assays revealed that the putative adhesin TraN in the donor mediates the specificity of surface exclusion. Mating assays with TraN homologs from related untyped plasmids from Aeromonas spp. and Photobacterium damselae identified two surface exclusion groups, with each Sfx being specific of TraN homologs from the same group. Together, these results allow us to better understand the apparent incompatibility between IncA and IncC plasmids and to propose a mechanistic model for surface exclusion mediated by Sfx in IncC plasmids and related elements, with implications for the rampant dissemination of antibiotic resistance. Author summary Bacterial conjugation plays a pivotal role in the evolution of bacterial populations. The circulation of drug resistance genes bolsters the emergence of multidrug-resistant pathogens, with which contemporary medicine struggles to cope. Exclusion is a natural process preventing the redundant acquisition of a plasmid via conjugation by a host harbouring an identical or similar plasmid. Although exclusion has been known for the past half-century, the mechanisms involved remain poorly understood. This study describes an exclusion factor, Sfx, encoded by IncC, IncA and related conjugative plasmids and by unrelated integrative and mobilizable elements. We report that Sfx is a lipoprotein of the recipient that selectively inhibits conjugation based on the adhesin TraN expressed at the surface of the donor. We propose a mechanistic model for Sfx-mediated exclusion. Ultimately, a better understanding of exclusion could facilitate the design of conjugation inhibitors targeting mating pair formation to curb the circulation of drug-resistance genes in healthcare settings, agriculture, animal husbandry and food and drug production.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».