A Bright and Ionizable Cytosine Mimic for <i>i</i>-Motif Structures
Notice bibliographique
Résumé
A new fluorescent cytosine analog “ ts C” containing a trans -stilbene moiety was synthesized and incorporated into hemiprotonated base pairs that comprise i -motif structures. Unlike previously reported fluorescent base analogs, ts C mimics the acid–base properties of cytosine (p K a ≈ 4.3) while exhibiting bright (ε × Φ ≈ 1000 cm –1 M –1 ) and red-shifted fluorescence (λ em = 440 → 490 nm) upon its protonation in the water-excluded interface of ts C +:C base pairs. Ratiometric analyses of ts C emission wavelengths facilitate real-time tracking of reversible conversions between single-stranded, double-stranded, and i -motif structures derived from the human telomeric repeat sequence. Comparisons between local changes in ts C protonation with global structure changes according to circular dichroism suggest partial formation of hemiprotonated base pairs in the absence of global i -motif structures at pH = 6.0. In addition to providing a highly fluorescent and ionizable cytosine analog, these results suggest that hemiprotonated C +:C base pairs can form in partially folded single-stranded DNA in the absence of global i -motif structures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».