A Bright and Ionizable Cytosine Mimic for <i>i</i>-Motif Structures
Notice bibliographique
Résumé
A new fluorescent cytosine analog “ ts C” containing a trans -stilbene moiety was synthesized and incorporated into hemiprotonated base pairs that comprise i -motif structures. Unlike previously reported fluorescent base analogs, ts C mimics the acid–base properties of cytosine (p K a ≈ 4.3) while exhibiting bright (ε × Φ ≈ 1000 cm –1 M –1 ) and red-shifted fluorescence (λ em = 440 → 490 nm) upon its protonation in the water-excluded interface of ts C +:C base pairs. Ratiometric analyses of ts C emission wavelengths facilitate real-time tracking of reversible conversions between single-stranded, double-stranded, and i -motif structures derived from the human telomeric repeat sequence. Comparisons between local changes in ts C protonation with global structure changes according to circular dichroism suggest partial formation of hemiprotonated base pairs in the absence of global i -motif structures at pH = 6.0. In addition to providing a highly fluorescent and ionizable cytosine analog, these results suggest that hemiprotonated C +:C base pairs can form in partially folded single-stranded DNA in the absence of global i -motif structures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».