Spi-C and PU.1 Counterregulate <i>Rag1</i> and <i>Ig</i>κ Transcription to Effect Vκ-Jκ Recombination in Small Pre-B Cells
Notice bibliographique
Résumé
B cell development requires the ordered rearrangement of Ig genes encoding H and L chain proteins that assemble into BCRs or Abs capable of recognizing specific Ags. Igκ rearrangement is promoted by chromatin accessibility and by relative abundance of RAG1/2 proteins. Expression of the E26 transformation-specific transcription factor Spi-C is activated in response to dsDNA double-stranded breaks in small pre-B cells to negatively regulate pre-BCR signaling and Igκ rearrangement. However, it is not clear if Spi-C regulates Igκ rearrangement through transcription or by controlling RAG expression. In this study, we investigated the mechanism of Spi-C negative regulation of Igκ L chain rearrangement. Using an inducible expression system in a pre-B cell line, we found that Spi-C negatively regulated Igκ rearrangement, Igκ transcript levels, and Rag1 transcript levels. We found that Igκ and Rag1 transcript levels were increased in small pre-B cells from Spic-/- mice. In contrast, Igκ and Rag1 transcript levels were activated by PU.1 and were decreased in small pre-B cells from PU.1-deficient mice. Using chromatin immunoprecipitation analysis, we identified an interaction site for PU.1 and Spi-C located in the Rag1 promoter region. These results suggest that Spi-C and PU.1 counterregulate Igκ transcription and Rag1 transcription to effect Igκ recombination in small pre-B cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».