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Enregistrement W4377138186 · doi:10.1101/2023.05.17.541065

Tomato CYP94C1 terminates jasmonate signaling during fruit ripening by inactivating bioactive jasmonoyl-L-isoleucine

2023· preprint· en· W4377138186 sur OpenAlexfundno aff
Tianxia Yang, Lei Deng, Chuanlong Sun, Muhammad Ali, Fangming Wu, Huawei Zhai, Qian Xu, Peiyong Xin, Jinfang Chu, Tingting Huang, Changbao Li, Chuanyou Li

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésRipeningBotrytis cinereaClimactericTranscription factorMethyl jasmonateJasmonic acidEthyleneBiologyJasmonateSignal transductionGeneBiochemistryBotanyCell biologyMutantGeneticsArabidopsis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Ripe fruits are more susceptible to necrotrophic pathogens than unripe fruits. Although this phenomenon is widespread across different fruit species and results in substantial economic losses, the underlying mechanism is still poorly understood. Previous studies revealed that ethylene (ET) is a key signal controlling climacteric fruit ripening and that jasmonate (JA) regulates plant resistance to necrotrophs. We investigated the function of tomato cytochrome P450 94 ( CYP94 ) family genes in JA signaling and report here that ET-mediated ripening suppresses JA-mediated defense by promoting the deactivation of bioactive JA-Ile. ETHYLENE-INSENSITIVE 3 (EIN3)/EIN3-LIKE (EIL) transcription factors directly activated CYP94C1 to convert JA-Ile to its inactive form 12-COOH-JA-Ile, thereby terminating JA signaling during fruit ripening. Mutation of CYP94C1 led to increased resistance of ripe fruits to the necrotrophic pathogen Botrytis cinerea without affecting the ripening process. Additionally, the master transcription factor MYC2 directly activated two other CYP94 members CYP94B1 and CYP94B2 to convert JA-Ile to its less active form 12-OH-JA-Ile, thereby attenuating JA signaling in wounded leaves. Simultaneous mutation of CYP94B1 and CYP94B2 increased the resistance of leaves to B. cinerea . Thus, differences in the expression and enzymatic activities of CYP94 family gene members precisely control JA-mediated defense responses in tomato.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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