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Enregistrement W4377717228 · doi:10.1109/tnb.2023.3276867

Deep Learning Based Parameterization of Diffeomorphic Image Registration for Cardiac Image Segmentation

2023· article· en· W4377717228 sur OpenAlexafffund
Ameneh Sheikhjafari, Deepa Krishnaswamy, Michelle Noga, Nilanjan Ray, Kumaradevan Punithakumar

Notice bibliographique

RevueIEEE Transactions on NanoBioscience · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMedical Image Segmentation Techniques
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Innovates
Mots-clésSegmentationArtificial intelligenceComputer scienceComputer visionDiffeomorphismImage segmentationHausdorff distanceTransformation (genetics)Pattern recognition (psychology)Geometric transformationImage registrationImage (mathematics)Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiac segmentation from magnetic resonance imaging (MRI) is one of the essential tasks in analyzing the anatomy and function of the heart for the assessment and diagnosis of cardiac diseases. However, cardiac MRI generates hundreds of images per scan, and manual annotation of them is challenging and time-consuming, and therefore processing these images automatically is of interest. This study proposes a novel end-to-end supervised cardiac MRI segmentation framework based on a diffeomorphic deformable registration that can segment cardiac chambers from 2D and 3D images or volumes. To represent actual cardiac deformation, the method parameterizes the transformation using radial and rotational components computed via deep learning, with a set of paired images and segmentation masks used for training. The formulation guarantees transformations that are invertible and prevents mesh folding, which is essential for preserving the topology of the segmentation results. A physically plausible transformation is achieved by employing diffeomorphism in computing the transformations and activation functions that constrain the range of the radial and rotational components. The method was evaluated over three different data sets and showed significant improvements compared to exacting learning and non-learning based methods in terms of the Dice score and Hausdorff distance metrics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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