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Enregistrement W4378085747 · doi:10.5376/cmb.2022.12.0005

Identification and Expression Characteristic Analysis of CML Gene Family of Melon

2022· article· en· W4378085747 sur OpenAlexvenueno aff
Lan Luo, Si Xiuyang, Lei Sun, Peng Gao, Li Yong Yong, Wang Xuezheng

Notice bibliographique

RevueComputational Molecular Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvances in Cucurbitaceae Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMelonGene familyBiologyGeneFusarium oxysporumJasmonic acidGeneticsGene expressionHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calmodulin-like ( CML ) is one of the important Ca 2+ sensors, which plays an important role in plant growth and development and stress response. In this study, melon ( Cucumismelo L.) genomic data was used to identify the melon CML protein family using bioinformatics methods, and its physical and chemical properties, location information, gene structure, phylogeny, and promoter were analyzed. The results showed that 60 CmCML protein genes were identified in the melon genomic data, containing 1~4 EF-hand domains, which were unevenly distributed on 12 chromosomes. By analyzing the evolutionary treewith Arabidopsis CMLs , CmCML could It is divided into 8 groups, and the number of various groups is different. It has certain similarities with other plant CML family genes in group classification. In the promoter analysis, abscisic acid, jasmonic acid, auxin, and gibberellin were identified. And drought, low temperature, mechanical damage and other signal response homeopathic elements. Real-time fluorescence quantitative results showed that gene expression of melon CML protein family was induced by the specialization of Fusarium oxysporum, these results predicted that the transcriptional regulation of melon CML protein family may participate in the resistance response of melon wilt, which is the gene family. The functional identification of each member laid a theoretical foundation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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