Regulation of Alternative Splicing by Steroid Hormones
Notice bibliographique
Résumé
Steroid hormone signaling pathways are critical for organismal development and act through binding to nuclear receptors (NRs) driving transcriptional regulation. In this review, we summarize evidence for another-underrated-mechanism of action for steroid hormones: their ability to modulate the alternative splicing of pre-messenger RNA. Thirty years ago, pioneering studies used in vitro transfection of plasmids expressing alternative exons under the control of hormone-responsive promoters in cell lines. These studies demonstrated that steroid hormones binding to their NRs affected both gene transcription and alternative splicing outcomes. The advent of exon arrays and next-generation sequencing has allowed researchers to observe the effect of steroid hormones at the whole-transcriptome level. These studies demonstrate that steroid hormones regulate alternative splicing in a time-, gene-, and tissue-specific manner. We provide examples of the mechanisms by which steroid hormones regulate alternative splicing including 1) recruitment of dual-function proteins that behave as coregulators and splicing factors, 2) transcriptional regulation of splicing factor levels, 3) the alternative splicing of splicing factors or transcription factors that feed-forward regulate steroid hormone signaling, and 4) regulation of elongation rate. Experiments performed in vivo and in cancer cell lines highlight that steroid hormone-mediated alternative splicing occurs both in physiological and pathophysiologic states. Studying the effect of steroid hormones on alternative splicing is a fruitful avenue for research that should be exploited to discover new targets for therapeutic intervention.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».