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Enregistrement W4379053944 · doi:10.1016/j.celrep.2023.112578

Mutant IDH regulates glycogen metabolism from early cartilage development to malignant chondrosarcoma formation

2023· article· en· W4379053944 sur OpenAlexafffund
Sinthu Pathmanapan, Raymond Poon, Tomasa Barrientos De Renshaw, Puviindran Nadesan, Makoto Nakagawa, Gireesh Seesankar, Adrian Kwan Ho Loe, Hongyuan H. Zhang, Joan J. Guinovart, Jordi Durán, Christopher B. Newgard, Jay S. Wunder, Benjamin A. Alman

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone Tumor Diagnosis and Treatments
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésIsocitrate dehydrogenaseChondrosarcomaIDH1MutantIDH2BiologySomatic cellGlycogenMalignant transformationCancer researchGeneEnzymeGeneticsBiochemistryPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chondrosarcomas are the most common malignancy of cartilage and are associated with somatic mutations in isocitrate dehydrogenase 1 (IDH1) and IDH2 genes. Somatic IDH mutations are also found in its benign precursor lesion, enchondromas, suggesting that IDH mutations are early events in malignant transformation. Human mutant IDH chondrosarcomas and mutant Idh mice that develop enchondromas investigated in our studies display glycogen deposition exclusively in mutant cells from IDH mutant chondrosarcomas and Idh1 mutant murine growth plates. Pharmacologic blockade of glycogen utilization induces changes in tumor cell behavior, downstream energetic pathways, and tumor burden in vitro and in vivo. Mutant IDH1 interacts with hypoxia-inducible factor 1α (HIF1α) to regulate expression of key enzymes in glycogen metabolism. Here, we show a critical role for glycogen in enchondromas and chondrosarcomas, which is likely mediated through an interaction with mutant IDH1 and HIF1α.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,169
Score d'incertitude au seuil0,955

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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