Saccharomyces cerevisiae Δ9-desaturase Ole1 forms a supercomplex with Slc1 and Dga1
Notice bibliographique
Résumé
Biosynthesis of the various lipid species that compose cellular membranes and lipid droplets depends on the activity of multiple enzymes functioning in coordinated pathways. The flux of intermediates through lipid biosynthetic pathways is regulated to respond to nutritional and environmental demands placed on the cell necessitating that there be flexibility in pathway activity and organization. This flexibility can in part be achieved through the organization of enzymes into metabolon supercomplexes. However, the composition and organization of such supercomplexes remain unclear. Here, we identified protein-protein interactions between acyltransferases Sct1, Gpt2, Slc1, Dga1, and the Δ9 acyl-CoA desaturase Ole1 in Saccharomyces cerevisiae. We further determined that a subset of these acyltransferases interact with each other independent of Ole1. We show that truncated versions of Dga1 lacking the carboxyl-terminal 20 amino acid residues are nonfunctional and unable to bind Ole1. Furthermore, charged-to-alanine scanning mutagenesis revealed that a cluster of charged residues near the carboxyl terminus was required for the interaction with Ole1. Mutation of these charged residues disrupted the interaction between Dga1 and Ole1 but allowed Dga1 to retain catalytic activity and to induce lipid droplet formation. These data support the formation of a complex of acyltransferases involved in lipid biosynthesis that interacts with Ole1, the sole acyl-CoA desaturase in S. cerevisiae, that can channel unsaturated acyl chains toward phospholipid or triacylglycerol synthesis. This desaturasome complex may provide the architecture that allows for the necessary flux of de novo-synthesized unsaturated acyl-CoA to phospholipid or triacylglycerol synthesis as demanded by cellular requirements.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».