MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4379054093 · doi:10.1016/j.jbc.2023.104882

Saccharomyces cerevisiae Δ9-desaturase Ole1 forms a supercomplex with Slc1 and Dga1

2023· article· en· W4379054093 sur OpenAlexafffund
Brianna Greenwood, Zijun Luo, Tareq Ahmed, Daniel Q. Huang, David A. Stuart

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Dentistry, University of AlbertaAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity Hospital FoundationCanada Foundation for InnovationUniversity of Alberta
Mots-clésSaccharomyces cerevisiaeBiochemistryChemistryBiologyYeast

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biosynthesis of the various lipid species that compose cellular membranes and lipid droplets depends on the activity of multiple enzymes functioning in coordinated pathways. The flux of intermediates through lipid biosynthetic pathways is regulated to respond to nutritional and environmental demands placed on the cell necessitating that there be flexibility in pathway activity and organization. This flexibility can in part be achieved through the organization of enzymes into metabolon supercomplexes. However, the composition and organization of such supercomplexes remain unclear. Here, we identified protein-protein interactions between acyltransferases Sct1, Gpt2, Slc1, Dga1, and the Δ9 acyl-CoA desaturase Ole1 in Saccharomyces cerevisiae. We further determined that a subset of these acyltransferases interact with each other independent of Ole1. We show that truncated versions of Dga1 lacking the carboxyl-terminal 20 amino acid residues are nonfunctional and unable to bind Ole1. Furthermore, charged-to-alanine scanning mutagenesis revealed that a cluster of charged residues near the carboxyl terminus was required for the interaction with Ole1. Mutation of these charged residues disrupted the interaction between Dga1 and Ole1 but allowed Dga1 to retain catalytic activity and to induce lipid droplet formation. These data support the formation of a complex of acyltransferases involved in lipid biosynthesis that interacts with Ole1, the sole acyl-CoA desaturase in S. cerevisiae, that can channel unsaturated acyl chains toward phospholipid or triacylglycerol synthesis. This desaturasome complex may provide the architecture that allows for the necessary flux of de novo-synthesized unsaturated acyl-CoA to phospholipid or triacylglycerol synthesis as demanded by cellular requirements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetLipid metabolism and biosynthesisTravaux en français237 207