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Enregistrement W4379055582 · doi:10.3390/fermentation9060534

Production of Glyoxylate from Glucose in Engineered Escherichia coli

2023· article· en· W4379055582 sur OpenAlexfundno aff
Bùi Hoàng Đăng Long, Masahiro Nishiyama, Rintaro Sato, Tomonari Tanaka, Hitomi Ohara, Yuji Aso

Notice bibliographique

RevueFermentation · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Brain Research CentreYale University
Mots-clésGlyoxylate cycleMalate synthaseIsocitrate lyaseEscherichia coliBiochemistryCitrate synthaseBiologyMetabolic engineeringGlyoxysomeChemistryEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glyoxylates are essential intermediates in several metabolic pathways and have a broad range of industrial applications. In this study, we propose a novel method for producing glyoxylate from glucose using engineered Escherichia coli BW25113. To direct the production of glyoxylate from glucose, malate synthase A (aceB), malate synthase G (glcB), glyoxylate carboligase (gcl), and glyoxylate/hydroxypyruvate reductase A (ycdW) genes were disrupted, and the glyoxylate shunt was reinforced in the disruptants by the overexpression of citrate synthase (gltA) and isocitrate lyase (aceA). In flask cultivation using M9 medium supplemented with 1% glucose, the disruptant E. coli BW25113 ΔaceB ΔglcB Δgcl ΔycdW produced 0.93 ± 0.17 g/L of glyoxylate. Further overexpression of gltA and aceA in the disruptant resulted in an improvement in glyoxylate production to 1.15 ± 0.02 g/L. By expressing a heterologous gene, pyc, in the engineered E. coli, the accumulation of intracellular oxaloacetate remarkably improved, leading to glyoxylate production of up to 2.42 ± 0.00 g/L with specific productivity at 4.22 ± 0.09 g/g-cell. To date, this is the highest reported titer and specific productivity of glyoxylate in E. coli.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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