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Enregistrement W4379390159 · doi:10.21203/rs.3.rs-2944450/v1

Association of extensive RNA disruption with natural killer cell-mediated death of K562 chronic myelogenous leukemia cells

2023· preprint· en· W4379390159 sur OpenAlexafffund
Isabella Pascheto, Baoqing Guo, Aseem Kumar, Laura B. Pritzker, Amadeo M. Parissenti

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensHealth Sciences NorthLaurentian University
Organismes subventionnairesMitacsEberhard Karls Universität Tübingen
Mots-clésK562 cellsProgrammed cell deathCancer researchRNABiologyLeukemiaCellImmunologyApoptosisGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Extensive degradation of tumour 28S and 18S ribosomal RNAs, coupled with the accumulation of ribosomal RNA degradation products, is associated with pathologic complete response and improved disease-free-survival in breast cancer patients. Various chemotherapy agents and cellular stressors are known to trigger this process, termed ‘RNA disruption’, in tumour cells. However, it’s unclear whether immunotherapies, with or without chemotherapy administration, also trigger RNA disruption. To address this question, we assessed the ability of natural killer (NK) cells to induce RNA disruption and cell death in K562 chronic myeloid leukemia cells in vitro. We found that NK cells strongly stimulated RNA disruption, cytotoxicity (loss of plasma membrane integrity) and cell death (generation of cells with a subG1 DNA content) in K562 cells. Pre-activation of NK cells with interleukin-2 or pre-treatment of K562 cells with the chemotherapy drug doxorubicin augmented RNA disruption in K562 cells. RNA degradation patterns looked very similar between NK cell-treated and doxorubicin-treated K562 cells. Our observations suggest that RNA disruption is strongly associated with cell death irrespective of the death-inducing stimulus and raise the prospect that tumour RNA disruption may be a useful biomarker for quantifying cancer patients’ response to immunotherapies, with or without co-administration of chemotherapy drugs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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