Identification and Expression Profiles of the WRKY Gene Family in Pecan (<i>Carya illinoinensis</i>)
Notice bibliographique
Résumé
WRKY gene family encodes a large transcription factor family that play critical roles in various physiological processes. However, a systematic analysis of the WRKY transcription factor family has not been reported in pecan ( Carya illinoinensis ). In this study, a total of 89 putative pecan WRKY genes ( CiWRKYs ), named CiWRKY1-89 , were identified from the whole genome of pecan. Most of WRKY domain sequences in CiWRKY proteins were “WRKYGQK”, but there were “WRKYGKK” in CiWRKY19, CiWRKY27 and CiWRKY88, and “WKKYGQK” in CiWRKY85. All CiWRKYs were unevenly distributed on 16 chromosomes, the largest number of genes on chromosome 3. Based on phylogenetic analysis, the 89 putative CiWRKYs could be classified into three major groups. The CiWRKY genes shared similar exon-intron distribution, and conserved motifs within the same subgroups. Expression profiles indicated that CiWRKY16 , CiWRKY30 , CiWRKY42 , CiWRKY62 , and CiWRKY69 genes were involved in flower differentiation and development, and majority of CiWRKYs genes were differentially expressed during embryo development. The present study provides reference for further comparative genomics and functional studies of this important class of transcriptional regulators in pecan.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».