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Enregistrement W4379966658 · doi:10.1002/smll.202303007

Nucleic Acid Enzyme‐Activated CRISPR‐Cas12a With Circular CRISPR RNA for Biosensing

2023· article· en· W4379966658 sur OpenAlex
Yunping Wu, Dingran Chang, Yangyang Chang, Qiang Zhang, Yi Liu, John D. Brennan, Yingfu Li, Meng Liu

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueSmall · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésCRISPRTrans-activating crRNANucleic acidRNADNARibozymeDeoxyribozymeBiologyComputational biologyCas9GeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-Cas systems are increasingly used in biosensor development. However, directly translating recognition events for non-nucleic acid targets by CRISPR into effective measurable signals represents an important ongoing challenge. Herein, it is hypothesized and confirmed that CRISPR RNAs (crRNAs) in a circular topology efficiently render Cas12a incapable of both site-specific double-stranded DNA cutting and nonspecific single-stranded DNA trans cleavage. Importantly, it is shown that nucleic acid enzymes (NAzymes) with RNA-cleaving activity can linearize the circular crRNAs, activating CRISPR-Cas12a functions. Using ligand-responsive ribozymes and DNAzymes as molecular recognition elements, it is demonstrated that target-triggered linearization of circular crRNAs offers great versatility for biosensing. This strategy is termed as "NAzyme-Activated CRISPR-Cas12a with Circular CRISPR RNA (NA3C)." Use of NA3C for clinical evaluation of urinary tract infections using an Escherichia coli-responsive RNA-cleaving DNAzyme to test 40 patient urine samples, providing a diagnostic sensitivity of 100% and specificity of 90%, is further demonstrated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,859

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle