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Enregistrement W4379984669 · doi:10.1158/1538-7445.am2023-645

Abstract 645: Impact of sex differences on cross-talk between the gut microbiome, CEACAMs, and TGF-β signaling in cancers

2023· article· en· W4379984669 sur OpenAlexaff
Krishanu Bhowmick, Addison Klebanov, Sahara John, Xiaochun Yang, Xiyan Xiang, Anil K. Vegesna, Kazufumi Ohshiro, James M. Crawford, Nicole Beauchemin, Raja Mazumder, Keith A. Crandall, Lopa Mishra

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory mediators and NSAID effects
Établissements canadiensConcordia UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMicrobiomeImmune systemCancer researchImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Sex differences, microbiome alterations and obesity are prominent factors modulating gastrointestinal (GI) cancers, such as colorectal cancer (CRC) and hepatocellular carcinoma (HCC). However, there is a limited understanding of the interactions between intestinal epithelial and immune cells that participate in the regulation of the microbiome and the prevention or promotion of inflammation and the development of cancer. CEACAM proteins are immune and epithelial cell regulators, and some CEACAMs (CEACAM1, 3, 5, and 6) bind to pathogenic microbes. CEACAMs and mutations of the encoding genes are potential drivers of microbiome changes through altered regulation of host-immune response, through a mechanism that we hypothesize involves TGF-β signaling. We found that genetic alterations in CEACAM-encoding genes correlate with scores of TGF-β pathway activity in GI cancers in The Cancer Genome Atlas (TCGA). Furthermore, nearly 40% of human GI cancers have genetic alterations in components and regulators of the TGF-β pathway. We, therefore, investigated crosstalk between pathogen-binding CEACAM1, the gut microbiome, and the multifunctional intrinsically disordered protein βII-spectrin (SPTBN1), a Smad3 adaptor in driving CRC and liver cancers. Methods: The DNA from fecal samples collected from wild-type mice or TGF-β signaling-deficient mice Smad4+/-Sptbn1+/- were analyzed through shotgun metagenomics sequencing to identify changes in gut microbiota composition. We examined CEACAM expression, changes in the T cell populations, liver inflammation, and cancer in tissues from liver-specific βII-spectrin knockout (LSKO) mice fed a Western diet. Results: Mice heterozygous for the Sptbn1 gene (Sptbn1+/-) combined with heterozygosity of Smad4 (Smad4+/-Sptbn1+/-) spontaneously developed GI cancers, in the C57BL/6J genetic background. These mice exhibit an increased bacterial species associated with CRC in humans (C. septicum) and decreased commensal gut microbes associated with a healthy microbiome (B. vulgatus, P. distasonis). In addition, male Sptbn1+/- mice spontaneously developed HCC and showed reduced regulatory T (Treg) cells, whereas female mice did not, suggesting that βII-spectrin has a role in immune cell homeostasis that may affect tumor suppression. Single cell analyses revealed that Ceacam1 expression decreases in hepatocytes in mice fed a Western diet. CEACAM1 levels are restored to normal in tissues from liver-specific βII-spectrin knockout (LSKO) mice. Furthermore, we observed diet-induced changes in the T cell populations, liver inflammation, and cancer are also blocked in LSKO mice. Conclusion: Our study highlights how two critical pathways, TGF-β signaling and immune mediators CEACAM1 and 5, can drive inflammation and cancer through microbiome alterations with host sex having marked impact on the relevant signaling pathways. Citation Format: Krishanu Bhowmick, Addison Klebanov, Sahara John, Xiaochun Yang, Xiyan Xiang, Anil Vegesna, Kazufumi Ohshiro, James M. Crawford, Nicole Beauchemin, Raja Mazumder, Keith A. Crandall, Lopa Mishra. Impact of sex differences on cross-talk between the gut microbiome, CEACAMs, and TGF-β signaling in cancers [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2023; Part 1 (Regular and Invited Abstracts); 2023 Apr 14-19; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2023;83(7_Suppl):Abstract nr 645.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,457
Écart entre enseignants0,361 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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