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Enregistrement W4380081934 · doi:10.1002/9781118960608.fbm00363

<i>Mesoaciditogaceae</i>

2023· other· en· W4380081934 sur OpenAlexaff
Stéphane L’Haridon, Camilla Nesbø, Anne A. Farrell, Olga Zhaxybayeva

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2023
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSeawaterGenusThermophile16S ribosomal RNABiologyHydrothermal ventType genusBacteriaHydrothermal circulationType speciesHabitatType (biology)BotanyZoologyEcologyGeneticsPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Me.so.a.ci.di.to.ga.ce'ae. N.L. fem. n. Mesoaciditoga type genus of the family; L. fen, pl. n. suff. ‐aceae, ending denoting a family; N.L. fem. pl. n. Mesoaciditogaceae , the Mesoaciditoga family. The family Mesoaciditogaceae , the only family in the order Mesoaciditogales , comprises thermophilic, weakly acidophilic bacteria. The cells stain Gram‐negative and are sheathed short rods . Members of this family are heterotrophs and anaerobes , growing optimally at salinities that range from freshwater to marine seawater. Known habitats are deep‐sea hydrothermal vents and acidic terrestrial hot springs. The family currently accommodates two genera, Mesoaciditoga and Athalassotoga . Only two species have been described, but additional 16S rRNA sequences and metagenomes from environmental samples suggest that Mesoaciditogaceae may include additional genera whose representatives are not yet isolated. DNA G + C content (mol%) : 39.9–40.6 (genome analysis). Type genus : Mesoaciditoga Reysenbach et al. 2013 VP . Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the family Mesoaciditogaceae is: correct name (last update, April 2026) * . LPSN classification: Bacteria / Thermotogati / Thermotogota / Thermotogae / Mesoaciditogales / Mesoaciditogaceae The family Mesoaciditogaceae can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as f__Mesoaciditogaceae (version v232) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Thermotogota / c__Thermotogae / o__Mesoaciditogales / f__Mesoaciditogaceae * Freese , H.M. , Meier‐Kolthoff , J.P. , Sardà Carbasse , J. , Afolayan , A.O. , Göker , M. ( 2026 ). TYGS and LPSN in 2025: a Global Core Biodata Resource for genome‐based classification and nomenclature of prokaryotes within DSMZ Digital Diversity. Nucleic Acids Res , 54 (), D884 – D891 ; doi: 10.1093/nar/gkaf1110 ** Parks , D.H. , Chaumeil , P.‐A.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,142
Score d'incertitude au seuil0,475

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1420,079

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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