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Enregistrement W4380371865 · doi:10.1016/j.celrep.2023.112634

Identification of aryl hydrocarbon receptor as a barrier to HIV-1 infection and outgrowth in CD4+ T cells

2023· article· en· W4380371865 sur OpenAlexafffund
Debashree Chatterjee, Yuwei Zhang, Christ-Dominique Ngassaki-Yoka, Antoine Dutilleul, Soumia Khalfi, Olivier Hernalsteens, Tomas Raul Wiche Salinas, Jonathan Dias, Huicheng Chen, Yasmine Smail, Jean-Philippe Goulet, Brendan Bell, Jean‐Pierre Routy, Carine Van Lint, Petronela Ancuța

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de SherbrookeUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute on Drug AbuseCanadian Institutes of Health ResearchFonds pour la Formation à la Recherche dans l’Industrie et dans l’AgricultureAustralian Research CouncilKoning BoudewijnstichtingNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversité Libre de BruxellesInternational Association of SedimentologistsLes Amis des Instituts Pasteur à BruxellesEuropean AIDS Treatment NetworkOffice of Extramural Research, National Institutes of HealthEuropean CommissionMcGill University Health CentreNational Institutes of HealthFondation du CHUMWaalse GewestMcGill UniversityViiV HealthcareThomas Jefferson UniversityFonds de Recherche du Québec - SantéInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCanadian Foundation for AIDS ResearchAgence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites ViralesFonds De La Recherche Scientifique - FNRSUniversité Laval
Mots-clésAryl hydrocarbon receptorBiologyViral replicationChromatin immunoprecipitationVesicular stomatitis virusT cellTranscription factorVirologyCell biologyImmunologyPromoterVirusImmune systemGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aryl hydrocarbon receptor (AhR) regulates Th17-polarized CD4 + T cell functions, but its role in HIV-1 replication/outgrowth remains unknown. Genetic (CRISPR-Cas9) and pharmacological inhibition reveal AhR as a barrier to HIV-1 replication in T cell receptor (TCR)-activated CD4 + T cells in vitro . In single-round vesicular stomatitis virus (VSV)-G-pseudotyped HIV-1 infection, AhR blockade increases the efficacy of early/late reverse transcription and subsequently facilitated integration/translation. Moreover, AhR blockade boosts viral outgrowth in CD4 + T cells of people living with HIV-1 (PLWH) receiving antiretroviral therapy (ART). Finally, RNA sequencing reveals genes/pathways downregulated by AhR blockade in CD4 + T cells of ART-treated PLWH, including HIV-1 interactors and gut-homing molecules with AhR-responsive elements in their promoters. Among them, HIC1, a repressor of Tat-mediated HIV-1 transcription and a tissue-residency master regulator, is identified by chromatin immunoprecipitation as a direct AhR target. Thus, AhR governs a T cell transcriptional program controlling viral replication/outgrowth and tissue residency/recirculation, supporting the use of AhR inhibitors in "shock and kill" HIV-1 remission/cure strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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