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Enregistrement W4380372174 · doi:10.1093/neuonc/noad073.083

DIPG-36. H3K27M HISTONE MUTANT GLIOMAS ARE SENSITIVE TO METHIONINE LOSS AND MAT2A INHIBITION THROUGH A NOVEL FEEDBACK MECHANISM BETWEEN AMD1 AND METTL16

2023· article· en· W4380372174 sur OpenAlexaff
Akanksha Chilukuri, Matthew Halbert, Brian Golbourn, Srinidhi Varadharajan, Brian Krug, Nneka E. Mbah, Stephanie M. Casillo, Taylor Gatesman, Andrea Cruz, Michael Zapotocky, Baoli Hu, Gary Kohanbash, Kelsey C. Bertrand, Claudia L. Kleinman, Costas A. Lyssiotis, Nada Jabado, Ian F. Pollack, Stephen C. Mack, Sameer Agnihotri

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensJewish General HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethionine AdenosyltransferaseMethionineEpigeneticsMethyltransferaseMethylationHistoneBiologyRegulatorCell biologyCancer researchBiochemistryAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Diffuse Midline gliomas (DMGs) are grade IV tumors by the World Health Organization. They are inoperable and resistant to chemo/radiotherapies resulting in a median survival of 8-11 months and a 5-year survival of <2%. DMG is an epigenetic disease characterized by mutations on histone H3.3 K27M resulting in global transcriptional reprogramming. This disease lacks appropriate models to predict disease biology and response to treatment. Therefore, we developed a novel syngeneic H3K27M mouse model using clinically relevant co-alterations in Olig2+ neural progenitor cells (NPCs). Using an unbiased systems biology approach, we identified a reliance of H3K27M but not isogenic controls to the amino acid methionine, and the enzymes methionine adenosyltransferase 2A (MAT2A), and adenosylmethionine decarboxylase 1 (AMD1). MAT2A is a master regulator of methionine metabolism that converts methionine into the universal methyl donor S-adenosylmethionine (SAM) which is later converted into decarboxylated SAM (dcSAM) by AMD1 for polyamine metabolism. We postulated that targeting methionine regulator MAT2A through genetic/pharmacological abrogation would selectively alter DMG viability by disrupting the methylome. We discovered a novel mechanism demonstrating H3K27M cells are sensitive to MAT2A loss independent of methylthioadenosine phosphorylase (MTAP) deletions but rather through AMD1 overexpression. The current paradigm shows that MAT2A protein expression is inversely correlated with cellular SAM concentrations as sensed by splicing complex and m6A reader methyltransferase-like protein 16 (METTL16). To investigate the molecular mechanism by which H3K27M represses MAT2A, we postulated that dcSAM, the resultant metabolite of AMD1, promote(s) high turnover of METTL16–MAT2A transcript interactions like SAM, thereby diminishing MAT2A transcript and protein expression. We found that exogenous dcSAM promoted MAT2A intron retention and lower mature transcript levels. Our findings demonstrate that H3K27M leads to increased AMD1 protein expression resulting in diminished MAT2A expression. Combinatorial treatments inhibiting MAT2A and AMD1 may presents exploitable therapeutic vulnerabilities in these gliomas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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