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Enregistrement W4380680885 · doi:10.1111/hiv.13520

Treatment‐emergent reverse transcriptase resistance during antiretroviral therapy with bictegravir, tenofovir alafenamide, and emtricitabine: A case series

2023· article· en· W4380680885 sur OpenAlexafffund
Samuel DeKoven, Mark Naccarato, Chanson J. Brumme, Darrell H. S. Tan

Notice bibliographique

RevueHIV Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoAIDS VancouverVancouver Infectious Diseases CentreUniversity of British ColumbiaSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesCanada Research Chairs
Mots-clésEmtricitabineMedicineTenofovir alafenamideVirologyDrug resistanceAbacavirViral quasispeciesResistance mutationReverse transcriptaseInternal medicineViral loadOncologyHuman immunodeficiency virus (HIV)GeneticsVirusAntiretroviral therapyBiologyPolymerase chain reactionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Bictegravir/tenofovir alafenamide/emtricitabine (BIC/TAF/FTC) is a complete regimen for the treatment of HIV with a high barrier to resistance and few reported cases of treatment failure. We present three cases of treatment-emergent resistance to nucleoside/nucleotide reverse transcriptase inhibitors (NRTIs) in patients with suboptimal treatment adherence and assess whether the resistance-associated mutations were present before BIC/TAF/FTC initiation or emerged during therapy. METHODS: We used genotypic drug resistance testing by Sanger sequencing to identify emergent resistance mutations in plasma viral load specimens collected after combination antiretroviral therapy initiation in all participants. Additionally, we performed ultra-deep sequencing by Illumina MiSeq on the earliest available plasma HIV-1 viral load specimen and on any available specimens closest in time to the initiation of BIC/TAF/FTC therapy to identify low-abundance resistance mutations present in the viral quasispecies. RESULTS: All three participants developed NRTI resistance after prolonged exposure and incomplete adherence to BIC/TAF/FTC. The T69N, K70E, M184I, and/or T215I mutations identified in clinical samples at the time of virological failure were not present on deep sequencing of either baseline samples or samples collected before BIC/TAF/FTC initiation. CONCLUSIONS: Despite a generally high genetic barrier to resistance, NRTI resistance-associated mutations may emerge during therapy with BIC/TAF/FTC in the setting of suboptimal adherence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,376
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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