Degradation of CNTNAP2 is mediated by both macroautophagy‐lysosome pathway and ubiquitin‐proteasome pathway
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Recent studies suggested Contactin‐associated protein‐like 2 (CNTNAP2) as a novel risk gene for Alzheimer’s disease (AD). Reduced expression levels of CNTNAP2 were found in the brains of AD patients. However, the mechanisms underlying CNTNAP2 protein degradation remain elusive. Method HEK and N2a cells transfected with human CNTNAP2 plasmid were treated with cycloheximide, lysosome inhibitors, and proteasome inhibitors. Immunoprecipitation was performed to study the interaction between CNTNAP2 and ubiquitin. Immunofluorescent staining was performed to investigate colocalization. Result Human CNTNAP2 protein has a half‐life of approximately 4 hours. CNTNAP2 protein has a glycosylated mature form on the cell membrane and an intracellular immature form. Mature CNTNAP2 was increased by lysosome inhibitors in a dose‐ and time‐dependent manner, while immature CNTNAP2 was increased by proteasome inhibitors dose‐ and time‐dependently. In addition, CNTNAP2 was co‐immunoprecipitated with ubiquitin and was increased by macroautophagy inhibitor 3‐MA. Immunofluorescent staining further showed the co‐localization of CNTNAP2 with ubiquitin and lysosome marker LAMP1. Conclusion Human CNTNAP2 is degraded via both lysosome and proteasome pathways. Dysregulation of lysosome and ubiquitin‐proteasome pathways have been implicated in AD. Therefore, the present degradation study of a risk gene may deepen the current understanding of AD pathogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».