A multiphasic approach to solve misidentification of Cutibacterium acnes as Atopobium vaginae during routine bacterial screening of platelet concentrates using the VITEK 2 system
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Skin flora bacteria, such as Cutibacterium acnes , are the predominant contaminants of blood products used for transfusion. Platelet concentrates (PCs), a therapeutic product used to treat patients with platelet deficiencies, are stored at ambient temperature under agitation, providing ideal conditions for bacterial proliferation. At Canadian Blood Services, PCs are screened for microbial contamination using the automated BACT/ALERT culture system. Positive cultures are processed and contaminating organisms are identified using the VITEK 2 system. Over a period of approximately 2 years, several PC isolates were identified as Atopobium vaginae to a high level of confidence. However, since A. vaginae is associated with bacterial vaginosis and is not a common PC contaminant, a retrospective investigation revealed that in all cases C. acnes was misidentified as A. vaginae . Our investigation demonstrated that the media type used to grow PC bacterial isolates can have a significant impact on the results obtained on the VITEK 2 system. Furthermore, other identification methods such as matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALD-TOF MS) and PCR amplification of the 16S RNA gene were only partially successful in the identification of C. acnes . Therefore, our findings support a multiphasic approach when PC isolates are identified as A. vaginae by the VITEK 2 system for proper identification of C. acnes using macroscopic, microscopic and other biochemical analyses.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle