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Enregistrement W4381089891 · doi:10.1093/narcan/zcad030

DICER1 platform domain missense variants inhibit miRNA biogenesis and lead to tumor susceptibility

2023· article· en· W4381089891 sur OpenAlexafffund
Dylan Pelletier, Anne‐Laure Chong, Mona K. Wu, Leora Witkowski, Sophie Albert, Nelly Sabbaghian, Marc R. Fabian, William D. Foulkes

Notice bibliographique

RevueNAR Cancer · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCongenital Diaphragmatic Hernia Studies
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Texas MD Anderson Cancer Center
Mots-clésMissense mutationGermlinemicroRNABiologyGeneticsEndoribonucleaseRibonuclease IIIBiogenesisSomatic cellGene silencingCancer researchGeneMutationRNase PRNA interferenceRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The endoribonuclease DICER1 plays an essential role in the microRNA (miRNA) biogenesis pathway, cleaving precursor miRNA (pre-miRNA) stem-loops to generate mature single-stranded miRNAs. Germline pathogenic variants (GPVs) in DICER1 result in DICER1 tumor predisposition syndrome (DTPS), a mainly childhood-onset tumor susceptibility disorder. Most DTPS-causing GPVs are nonsense or frameshifting, with tumor development requiring a second somatic missense hit that impairs the DICER1 RNase IIIb domain. Interestingly, germline DICER1 missense variants that cluster in the DICER1 Platform domain have been identified in some persons affected by tumors that also associate with DTPS. Here, we demonstrate that four of these Platform domain variants prevent DICER1 from producing mature miRNAs and as a result impair miRNA-mediated gene silencing. Importantly, we show that in contrast to canonical somatic missense variants that alter DICER1 cleavage activity, DICER1 proteins harboring these Platform variants fail to bind to pre-miRNA stem-loops. Taken together, this work sheds light upon a unique subset of GPVs causing DTPS and provides new insights into how alterations in the DICER1 Platform domain can impact miRNA biogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,610
Score d'incertitude au seuil0,677

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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