Differences in Saprophytic Growth, Virulence, Genomes, and Secretomes of Ilyonectria robusta and I. mors-panacis Isolates from Roots of American Ginseng (Panax quinquefolius)
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
A comparison of the virulence, saprophytic growth, and genomes of 12 isolates of Ilyonectria mors-panacis and 4 isolates of I. robusta from Canada pathogenic to Panax quinquefolius was made. There were no significant differences in the average lesion size on detached roots between isolates of the two Ilyonectria species or isolates that originated from infected roots in first- or second-crop ginseng soils. This did not support the hypotheses that I. mors-panacis is always more virulent than I. robusta or that there is selection for higher virulence during the first crop. However, the average growth rate on potato dextrose agar for I. robusta was significantly greater than that of I. mors-panacis, and the average total genome size of I. robusta isolates was significantly smaller with a significantly higher GC content. On dendrograms based on nucleotide sequences of all predicted exons of the genomes, I. robusta isolates were distinguishable from I. mors-panacis isolates, which were similar but could be separated into types 1 and 2. The difference between type 1 and type 2 I. mors-panacis was not related to geographical origin, virulence, growth rate, or mating type. However, the division was also observed for the total predicted secretome, most notably small secreted cysteine-rich proteins and secreted proteases, indicating that type 1 and 2 isolates of I. mors-panacis may interact differently with their environment.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle