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Enregistrement W4381377683 · doi:10.2337/db23-434-p

434-P: Urinary Proteome Classifiers in Prediabetes Clusters

2023· article· en· W4381377683 sur OpenAlexaboutno aff
Anja Schork, Andreas Fritsche, Erwin Schleicher, Andreas Peter, Martin Heni, Norbert Stefan, REINER JUMPERTZ VON SCHWARTZENBERG, Harald Mischak, Justyna Siwy, Andreas L. Birkenfeld, Róbert Wágner

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrediabetesMedicineDiabetes mellitusInternal medicineType 2 diabetesUrineBody mass indexKidney diseaseDiabetic nephropathyUrinary systemCohortEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Patients with prediabetes have recently been classified into 6 prediabetes clusters, that stratify the risk of diabetes and complications. Cluster 1, 2 and 4 are low risk-clusters while cluster 3, 5 and 6 are high-risk clusters. Of notice, especially patients of cluster 6 have an elevated risk of nephropathy despite their low diabetes risk. To investigate if differences across clusters can be captured from urine peptidome, we studied differences in pre-specified urinary peptidome classifiers across age and sex matched participants from 6 prediabetes clusters (n=249, median age 46 (IQR 39 - 54) years, BMI 30.4 (26.9 - 39.4) kg/m², HbA1c 5.5 (5.3 - 5.8) %). Methods: Peptides in spot urine samples collected at the University Hospital Tuebingen from 11/2004 to 11/2012 were investigated using capillary electrophoresis coupled mass spectroscopy. The following classifiers based on multiple urine peptides had been developed to detect different conditions and were assessed: CKD273 (chronic kidney disease, CKD), validated in a large clinical cohort), HF1 and HF2 (heart failure), CAD238 (coronary artery disease, CAD), Col_death (collagen type-1 turnover), solid_tumor (solid tumor). Matsuda index and NEFA insulin sensitivity index (ISI) were used for estimation of insulin sensitivity. Results: The urinary peptidome classifiers CKD273, HF2 and CAD238 were significantly different between prediabetes clusters, with elevated values in cluster 6 compared to the healthiest cluster 2. These classifiers also correlated with Matsuda index and NEFA ISI. Classifiers HF1, Col_death and solid_tumor did not associate with prediabetes clusters or insulin sensitivity indices. Conclusions: Beyond corroboration of a previously described increased risk of CKD, urinary peptidome classifiers suggest elevated risk of heart failure and coronary artery disease in persons of the prediabetes cluster 6. This could underlie increased mortality in this group, independent of diabetes development. Disclosure A.Schork: None. A.L.Birkenfeld: None. R.Wagner: Advisory Panel; Daiichi Sankyo, Speaker's Bureau; Novo Nordisk, Sanofi. A.Fritsche: Advisory Panel; Novo Nordisk, Lilly, Sanofi, Boehringer-Ingelheim, Speaker's Bureau; AstraZeneca, SYNLAB Holding Deutschland GmbH. E.D.Schleicher: None. A.Peter: None. M.Heni: Advisory Panel; Boehringer-Ingelheim, Sanofi, Research Support; Boehringer Ingelheim Inc., Speaker's Bureau; Lilly, Bayer Inc., Sanofi, Boehringer-Ingelheim, Novo Nordisk, Amryt Pharma Plc. N.Stefan: Advisory Panel; Pfizer Inc., Research Support; Sanofi, Speaker's Bureau; AstraZeneca, Boehringer Ingelheim (Canada) Ltd., Lilly Diabetes, Novo Nordisk, Sanofi-Aventis Deutschland GmbH. R.Jumpertz von schwartzenberg: Other Relationship; Sanofi, Amgen Inc., Lilly, Novo Nordisk. H.Mischak: Stock/Shareholder; Mosaiques Diagnostics. J.Siwy: Employee; Mosaiques-Diagnostics GmbH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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