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Enregistrement W4381470351 · doi:10.1080/07391102.2023.2224884

A comprehensive immunoinformatics study to explore and characterize potential vaccine constructs against Ole e 9 allergen of <i>Olea europaea</i>

2023· article· en· W4381470351 sur OpenAlexaff
Mohd Adnan Kausar, Tulika Bhardwaj, Fahaad Alenazi, Sadaf Anwar, Abrar Ali, Shimaa M. H. Aboelnaga, Mohammad Zeeshan Najm, Mοhd Saeed

Notice bibliographique

RevueJournal of Biomolecular Structure and Dynamics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTransgenic Plants and Applications
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOleaAllergenVirologyBiologyImmunologyAllergyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immunoglobulin E (IgE)-mediated allergy, which affects more than 30% of the population, is the most prevalent hypersensitivity illness. In an atopic individual, even a small amount of allergen exposure can cause IgE antibodies to be produced. Due to the engagement of receptors that are highly selective for IgE, even tiny amounts of allergens can induce massive inflammation. This study focuses on the exploration and characterization of the allergen potential of Olea europaea allergen (Ole e 9) affecting the population in Saudi Arabia. A systematic computational approach was performed to identify potential epitopes of allergens and complementary determining regions of IgE. In support, physiochemical characterization and secondary structure analysis unravel the structural conformations of allergens and active sites. Epitope prediction uses a pool of computational algorithms to identify plausible epitopes. Furthermore, the vaccine construct was assessed for its binding efficiency using molecular docking and molecular dynamics simulation studies, which led to strong and stable interactions. This is because IgE is known to play a role in allergic responses, which facilitate host cell activation for an immune response. Overall, the immunoinformatics analysis advocates that the proposed vaccine candidate is safe and immunogenic and therefore can be pushed as a lead for in vitro and in vivo investigations.Communicated by Ramaswamy H. Sarma

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,647
Score d'incertitude au seuil0,525

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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