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Enregistrement W4381715312 · doi:10.1177/19322968231181138

Simulating Realistic Continuous Glucose Monitor Time Series By Data Augmentation

2023· article· en· W4381715312 sur OpenAlexaff
Louis Gomez, Adedolapo Aishat Toye, R. Stanley Hum, Samantha Kleinberg

Notice bibliographique

RevueJournal of Diabetes Science and Technology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiabetes Management and Research
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesU.S. National Library of Medicine
Mots-clésContinuous glucose monitoringSeries (stratigraphy)Computer scienceBlood Glucose Self-MonitoringTime seriesMedicineType 1 diabetesDiabetes mellitusMachine learningBiologyEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Simulated data are a powerful tool for research, enabling benchmarking of blood glucose (BG) forecasting and control algorithms. However, expert created models provide an unrealistic view of real-world performance, as they lack the features that make real data challenging, while black-box approaches such as generative adversarial networks do not enable systematic tests to diagnose model performance. METHODS: To address this, we propose a method that learns missingness and error properties of continuous glucose monitor (CGM) data collected from people with type 1 diabetes (OpenAPS, OhioT1DM, RCT, and Racial-Disparity), and then augments simulated BG data with these properties. On the task of BG forecasting, we test how well our method brings performance closer to that of real CGM data compared with current simulation practices for missing data (random dropout) and error (Gaussian noise, CGM error model). RESULTS: Our methods had the smallest performance difference versus real data compared with random dropout and Gaussian noise when individually testing the effects of missing data and error on simulated BG in most cases. When combined, our approach was significantly better than Gaussian noise and random dropout for all data sets except OhioT1DM. Our error model significantly improved results on diverse data sets. CONCLUSIONS: We find a significant gap between BG forecasting performance on simulated and real data, and our method can be used to close this gap. This will enable researchers to rigorously test algorithms and provide realistic estimates of real-world performance without overfitting to real data or at the expense of data collection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,250
Score d'incertitude au seuil0,256

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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