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Enregistrement W4381846259 · doi:10.3389/fimmu.2023.1171103

The transcriptome response of astronaut leukocytes to long missions aboard the International Space Station reveals immune modulation

2023· article· en· W4381846259 sur OpenAlexafffund
Daniel Stratis, Guy Trudel, Lynda Rocheleau, Martin Pelchat, Odette Laneuville

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpaceflight effects on biology
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Space Agency
Mots-clésSpaceflightTranscriptomeInternational Space StationImmune systemBiologyDownregulation and upregulationGeneWeightlessnessGene expressionFold changeHousekeeping geneComputational biologyImmunologyGeneticsPhysicsAeronauticsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Spaceflight leads to the deconditioning of multiple body systems including the immune system. We sought to characterize the molecular response involved by capturing changes in leukocyte transcriptomes from astronauts transitioning to and from long-duration spaceflight. Methods: Fourteen male and female astronauts with ~6-month- long missions aboard the International Space Station (ISS) had 10 blood samples collected throughout the three phases of the study: one pre-flight (PF), four in-flight (IF) while onboard the ISS, and five upon return to Earth (R). We measured gene expression through RNA sequencing of leukocytes and applied generalized linear modeling to assess differential expression across all 10 time points followed by the analysis of selected time points and functional enrichment of changing genes to identify shifts in biological processes. Results: Our temporal analysis identified 276 differentially expressed transcripts grouped into two clusters (C) showing opposite profiles of expression with transitions to and from spaceflight: (C1) decrease-then-increase and (C2) increase-then-decrease. Both clusters converged toward average expression between ~2 and ~6 months in space. Further analysis of spaceflight transitions identified the decrease-then-increase pattern with most changes: 112 downregulated genes between PF and early spaceflight and 135 upregulated genes between late IF and R. Interestingly, 100 genes were both downregulated when reaching space and upregulated when landing on Earth. Functional enrichment at the transition to space related to immune suppression increased cell housekeeping functions and reduced cell proliferation. In contrast, egress to Earth is related to immune reactivation. Conclusion: The leukocytes' transcriptome changes describe rapid adaptations in response to entering space followed by opposite changes upon returning to Earth. These results shed light on immune modulation in space and highlight the major adaptive changes in cellular activity engaged to adapt to extreme environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,896
Score d'incertitude au seuil0,351

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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