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Enregistrement W4381890139 · doi:10.1101/2023.06.22.545970

Multichannel joint image reconstruction allows for artifact-free focused small field of view magnetic particle imaging

2023· preprint· en· W4381890139 sur OpenAlexaff
Julia J. Gevaert, Justin Konkle, Patrick Goodwill, Paula J. Foster

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueCharacterization and Applications of Magnetic Nanoparticles
Établissements canadiensRobarts Clinical TrialsWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMagnetic particle imagingSIGNAL (programming language)ScannerComputer scienceComputer visionArtifact (error)Field of viewEnhanced Data Rates for GSM EvolutionJoint (building)PhysicsOpticsArtificial intelligenceMagnetic nanoparticles

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Magnetic Particle Imaging (MPI) directly detects superparamagnetic iron oxide (SPIO) labeled cells. We have used MPI to detect SPIO-labeled dendritic cells (DC) migrated to the popliteal lymph nodes (pLN) after injection into the hind footpads. However, in some cases the low pLN signal could not be resolved from nearby higher footpad signal where window leveling to pLN signal oversaturated the footpad signal. The same limitation occurs when SPIO is injected intravenously, accumulates in the liver, and prevents isolation of regions of interest with lower signals. Previous studies have reported on the issue of resolving a wide range of differing iron concentration. A small focused field of view (FOV), to exclude high sources of nearby signal cannot be performed with the standard reconstruction algorithm equipped on the MomentumTM MPI scanner because it is assumed that there is no signal at the edge of the FOV and these values are set to zero for each line along the transmit axis. However, when there is signal at the FOV edge, an inverted negative artifact is created. The multichannel joint reconstruction method uses an iterative reconstruction technique to recover edge information using information from an orthogonal axis, preventing this artifact and allowing the user to prescribe a small FOV on the region of interest. Here we describe the implementation of this method to isolate and quantify low regions of MPI signal from higher regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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