SWI/SNF chromatin remodeling determines brassinosteroid-induced transcriptional activation
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The brassinosteroid (BR) hormone is a central modulator of plant growth, development, and responses to stresses by activating or repressing the expression of thousands of genes through the transcription factor BRASSINAZOLE-RESISTANT 1 (BZR1) and its homologues. However, the molecular mechanism that determines the transcriptional activation versus repression activity of BZR1 remains largely unclear. Here, we show that BZR1-responsive transcriptional activation at thousands of loci requires the Switch defective/sucrose non-fermentable (SWI/SNF)-complexes-mediated chromatin accessibility regulation. BR-activated BZR1 controls the activation or repression of thousands of BZR1 target genes through reprograming genome-wide chromatin accessibility landscape in Arabidopsis thaliana . BZR1 physically interacts with the B RAHMA (BRM)- A ssociated S WI/SNF complexes (BAS), co-localizes with BRM on the genome, and enhances BRM occupancy at sites of increased accessibility by BR. Loss of BRM abrogates the capacity of BZR1 to increase but not decrease chromatin accessibility, blocks BR-induced hypocotyl elongation, and diminishes BZR1-mediated transcriptional activation rather than repression. Together, our work reveals that the BAS chromatin remodeling complex is a critical epigenetic regulatory partner in dictating BZR1-mediated transcriptional activation ability, thus providing a long sought mechanistic explanation for how BR signaling activates gene transcription in shaping diverse developmental programs. Teaser BZR1-responsive transcriptional activation activity at thousands of loci requires the SWI/SNF-complexes-mediated chromatin accessibility regulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».