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Enregistrement W4382600368 · doi:10.14745/ccdr.v49i06a06f

Surveillance des tiques Ixodes scapularis et Ixodes pacificus et de leurs agents pathogènes associés, Canada, 2020

2023· article· fr· W4382600368 sur OpenAlexaffvenueabout
Christy Wilson, Salima Gasmi, Annie‐Claude Bourgeois, Jacqueline Badcock, Justin Carr, Navdeep Chahil, Heather Coatsworth, Antonia Dibernardo, Priya Goundar, Patrick A. Leighton, Min-Kuang Lee, Muhammad Morshed, Marion Ripoche, Hanan Smadi, Christa Smolarchuk, Karine Thivierge, Jules K. Koffi

Notice bibliographique

RevueRelevé des maladies transmissibles au Canada · 2023
Typearticle
Languefr
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensAlberta HealthMcGill UniversityBishop's UniversityGovernment of New BrunswickBC Centre for Disease ControlUniversity of British ColumbiaPublic Health Agency of CanadaUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIxodes scapularisIxodesBiologyGeographyZoologyVirologyTickAcariIxodidae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Contexte : Les tiques Ixodes scapularis et Ixodes pacificus sont les principaux vecteurs de l'agent pathogène de la maladie de Lyme et de plusieurs autres maladies transmises par les tiques au Canada.Les données de surveillance des tiques peuvent être utilisées pour déterminer les zones locales de risque de maladies transmises par les tiques et les interventions directes en santé publique.Le présent article vise à décrire les caractéristiques saisonnières et spatiales des principaux vecteurs de la maladie de Lyme au Canada, ainsi que les agents pathogènes transmis par les tiques, au moyen des données de surveillance passive et active de 2020.Méthodes : Des données de surveillance passive et active ont été compilées de la Direction générale du Laboratoire national de microbiologie (Agence de la santé publique du Canada), des autorités provinciales et locales de santé publique et d'eTick (une plateforme en ligne basée sur l'image).Les analyses saisonnières et spatiales des tiques et de leurs agents pathogènes connexes sont présentées, y compris les estimations de la prévalence des infections. Résultats: Dans le cadre de la surveillance passive, les données sur I. scapularis (n = 7 534) ont été présentées par toutes les provinces sauf le Manitoba et la Colombie-Britannique, tandis que les données sur I. pacificus (n = 718) ont été présentées uniquement par la Colombie-Britannique. Aucune donnée sur les tiques n'a été rapportée par les territoires.La répartition saisonnière des présentations pour I. scapularis étaient bimodales, mais unimodales pour I. pacificus.Quatre agents pathogènes transmis par les tiques ont été identifiés pour I. scapularis (Borrelia burgdorferi, Anaplasma phagocytophilum, Babesia microti et Borrelia miyamotoi) et un pour I. pacificus (B.miyamotoi).Pour la surveillance active, des données sur I. scapularis (n = 688) ont été recueillies en Ontario, au Québec et au Nouveau-Brunswick.Cinq agents pathogènes transmis par les tiques ont été identifiés : B. burgdorferi, A. phagocytophilum, B. microti, B. miyamotoi et le virus de Powassan.Conclusion : Le présent article donne un aperçu de la répartition de I. scapularis et de I. pacificus et de leurs agents pathogènes humains associés, au Canada en 2020, ce qui peut aider à évaluer le risque d'exposition à des agents pathogènes transmis par les tiques dans différentes provinces.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,155

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,006
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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