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Enregistrement W4382700158 · doi:10.1186/s13062-023-00390-w

Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and macrophage-to-mesenchymal transition in bicuspid calcific aortic valve disease

2023· article· en· W4382700158 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiology Direct · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesRenji HospitalShanghai Hospital Development CenterUniversidade de MacauNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyBicuspid aortic valveMesenchymal stem cellMacrophageStromal cellAortic valveCell typePhenotypeCellTranscriptomePopulationCalcificationCell biologyImmunologyIn vitroPathologyCancer researchGeneticsGeneInternal medicineGene expressionMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Bicuspid aortic valve (BAV) is the most prevalent congenital valvular heart defect, and around 50% of severe isolated calcific aortic valve disease (CAVD) cases are associated with BAV. Although previous studies have demonstrated the cellular heterogeneity of aortic valves, the cellular composition of specific BAV at the single-cell level remains unclear. Methods Four BAV specimens from aortic valve stenosis patients were collected to conduct single-cell RNA sequencing (scRNA-seq). In vitro experiments were performed to further validate some phenotypes. Results The heterogeneity of stromal cells and immune cells were revealed based on comprehensive analysis. We identified twelve subclusters of VICs, four subclusters of ECs, six subclusters of lymphocytes, six subclusters of monocytic cells and one cluster of mast cells. Based on the detailed cell atlas, we constructed a cellular interaction network. Several novel cell types were identified, and we provided evidence for established mechanisms on valvular calcification. Furthermore, when exploring the monocytic lineage, a special population, macrophage derived stromal cells (MDSC), was revealed to be originated from MRC1 + (CD206) macrophages (Macrophage-to-Mesenchymal transition, MMT). FOXC1 and PI3K-AKT pathway were identified as potential regulators of MMT through scRNA analysis and in vitro experiments. Conclusions With an unbiased scRNA-seq approach, we identified a full spectrum of cell populations and a cellular interaction network in stenotic BAVs, which may provide insights for further research on CAVD. Notably, the exploration on mechanism of MMT might provide potential therapeutic targets for bicuspid CAVD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,110
Score d'incertitude au seuil0,847

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle