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Enregistrement W4382937076 · doi:10.1038/s41592-023-01915-x

Minimum information guidelines for experiments structurally characterizing intrinsically disordered protein regions

2023· review· en· W4382937076 sur OpenAlexaff
Bálint Mészáros, András Hatos, Nicolás Palópoli, Federica Quaglia, Edoardo Salladini, Kim Van Roey, Haribabu Arthanari, Zsuzsanna Dosztányi, Isabella C. Felli, Patrick D. Fischer, Jeffrey C. Hoch, Cy M. Jeffries, Sonia Longhi, Emiliano Maiani, Sandra Orchard, Rita Pancsa, Elena Papaleo, Roberta Pierattelli, Damiano Piovesan, Iva Pritišanac, Luiggi Tenorio, Thibault Viennet, Péter Tompa, Wim Vranken, Silvio C. E. Tosatto, Norman E. Davey

Notice bibliographique

RevueNature Methods · 2023
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesFondazione Cassa di Risparmio di FirenzeHorizon 2020 Framework ProgrammeVrije Universiteit BrusselFondazione Umberto VeronesiDanmarks GrundforskningsfondEuropean CommissionNational Research, Development and Innovation OfficeNational Institutes of HealthCancer Research UK
Mots-clésIntrinsically disordered proteinsComputational biologyComputer scienceBiologyNanotechnologyBiophysicsMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,989
Score d'incertitude au seuil0,060

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,002
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0070,003
Intégrité de la recherche0,0060,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,012

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,474
Écart entre enseignants0,384 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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