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Enregistrement W4383069805 · doi:10.1139/cjfas-2023-0045

The future of fish age estimation: deep machine learning coupled with Fourier transform near-infrared spectroscopy of otoliths

2023· article· en· W4383069805 sur OpenAlexvenueno aff
Irina M. Benson, Thomas E. Helser, Giovanni Marchetti, Beverly K. Barnett

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueSpectroscopy and Chemometric Analyses
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Marine Fisheries ServiceNational Oceanic and Atmospheric Administration
Mots-clésOtolithMean squared errorFourier transformPattern recognition (psychology)Artificial intelligenceBiological systemData setMathematicsConvolutional neural networkAbsorbancePartial least squares regressionStatisticsFish <Actinopterygii>Computer scienceFisheryBiologyOpticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our novel approach for fish age prediction uses quantitative analysis of Fourier transform near-infrared (FT-NIR) spectra of otoliths by means of multimodal convolutional neural networks (MMCNN). We integrate two key data modalities that are related to fish ages: the entire range of wavenumbers of FT-NIR spectra and corresponding biological and geospatial data for nearly 9000 walleye pollock ( Gadus chalcogrammus) specimens. The proposed model extracts informative spectral features automatically and elucidates hidden structural relationships associated with fish growth to improve age predictions. Absorbance associated with 7000 to 4000 cm −1 wavenumbers had the highest influence on model predictions followed by fish length, latitude, depth, and temperature. The optimal model resulted in good overall performance with an R 2 of 0.93 and RMSE of 0.83 for training data set and R 2 of 0.92 and RMSE of 0.91 for test data set. MMCNN's age predictions were comparable to microscope-based ages yielding as good or slightly better precision. Moreover, the model outperformed classical partial least squares analysis of otolith spectra and remedied prediction bias at older ages of fish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,733
Score d'incertitude au seuil0,777

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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