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Enregistrement W4383342182 · doi:10.1021/acsmaterialsau.3c00029

Engineered In Vitro Tumor Model Recapitulates Molecular Signatures of Invasion in Glioblastoma

2023· article· en· W4383342182 sur OpenAlexafffund
Laura J. Smith, Arianna Skirzynska, Allysia A. Chin, Amy E. Arnold, Michelle Kushida, Peter B. Dirks, Molly S. Shoichet

Notice bibliographique

RevueACS Materials Au · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensCanada Research ChairsHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAmgenAmgen Foundation
Mots-clésExtracellular matrixGene knockdownCell biologyDownregulation and upregulationFocal adhesionIn vitroMesenchymal stem cellBiologyCancer researchCell cultureStem cellSignal transductionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glioblastoma stem cells (GSCs) play an important role in the invasive nature of glioblastoma (GBM); yet, the mechanisms driving this behavior are poorly understood. To recapitulate tumor invasion in vitro, we developed a GBM tumor-mimetic hydrogel using extracellular matrix components upregulated in patients. We show that our hydrogel facilitates the infiltration of a subset of patient-derived GSCs, differentiating samples based on phenotypic invasion. Invasive GSCs are enriched for injury-responsive pathways while noninvasive GSCs are enriched for developmental pathways, reflecting established GSC stratifications. Using small molecule inhibitors, we demonstrate that the suppression of matrix metalloprotease and rho-associated protein kinase processes results in a significant reduction of cell invasion into the hydrogel, reflecting mesenchymal- and amoeboid-dependent mechanisms. Similar reduction in cell invasion was observed by siRNA knockdown of ITGB1 and FAK focal adhesion pathways. We elucidate the transcriptomic profile of cells invading in the hydrogel by performing bulk RNA sequencing of cells cultured in the hydrogel and compare these to cells cultured in conventional tissue culture polystyrene (TCP). In our 3D hydrogel cultures, invasion-related molecular signatures along with proliferation and injury response pathways are upregulated while development processes are downregulated compared to culture on 2D TCP. With this validated in vitro model, we establish a valuable tool to find therapeutic intervention strategies against cellular invasion in glioblastoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,465

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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